推测187份玉米自交系基因组血统与分子亲缘关系(英文)

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢传晓

作者： 谢传晓;张世煌;李明顺;李新海;郝转芳;白丽;张德贵;梁业红

作者机构：

关键词： 玉米;遗传多样性;亲缘关系;连锁不平衡;关联性分析

期刊名称： 遗传学报

ISSN： 1673-8527

年卷期： 2007 年 34 卷 08 期

页码： 738-748

收录情况： SCI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 为提高育种效率以及开展重要 QTL 和关键基因关联性分析研究, 以 187 份生产上重要玉米自交系为材料, 以 70 个均匀分布于全基因组简单重复序列(SSR)基因座鉴定出的290个等位基因多态性为分析数据, 采用联合连锁位点与混合模型分析, 推测这些自交系的基因组血缘构成以及分子亲缘关系, 并分析了全基因连锁不平衡。当亚群数目 K=5 时, 导致似然值 P 明显下降, 亚群数据 K > 6 时, 似然值 P 没有明显上升, 表明群体结构的亚群数 K 最佳推测为 6。六个亚群分别为 PA、BSSS (含 Reid)、PB、兰卡斯特 (Lancaster)、旅大红骨 (旅大红骨及其衍生系)、四平头 (唐四平头及其衍生系)。亚群间的Kullback-Leibler 距离自 0.13 至 1.06 不等, 平均为 0.599, 各亚群间区分度较好。全基因组连锁不平衡(LD)分析表明: 与四平头种质类群内相比, 遗传基础宽泛种质的基因组内存在 LD"区块"(LD block)少且小, 对重要 QTLs 与基因的关联性分析可以避免假阳性。本研究群体结构与基因组构成分析数据为这些材料育种应用与改良提供了重要信息, 也为基于这些材料的关联性分析奠定了分析基础。

分类号： Q943`S513

  • 相关文献

[1]利用高密度SNP芯片评估中国地方肉牛品种基因组亲缘关系. 马浩然,张路培,金生云,宝金山,李红艳,高会江,徐凌洋,王泽昭,李俊雅. 2023

[2]40份玉米自交系的ISSR遗传多样性分析. 王寒玉,杜艳伟,李萍,张喜文,朱晶莹,赵晋锋,余爱丽. 2011

[3]玉米Gln1-3gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析. 吴永升,李新海,张征,李明顺,郝转芳,张世煌,谢传晓. 2008

[4]玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析. 吴永升,李新海,张征,李明顺,郝转芳,张世煌,谢传晓. 2008

[5]山西谷子核心资源群体结构及主要农艺性状关联分析. 王海岗,温琪汾,穆志新,乔治军. 2019

[6]关联分析在植物种质资源研究中的应用. 王秀全,何丹,庞启华,税红霞,卢庭启,蒋晓芳. 2014

[7]引进陆地棉种质材料的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡. 杨洋,马君,李波,胡文冉,王玉晶. 2015

[8]小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR 分析. 白鹏,程须珍,王丽侠,王素华,陈红霖. 2014

[9]Amy6-4基因遗传多样性及其与α-淀粉酶活性的关联分析. 姜晓东,郭刚刚,张京. 2014

[10]香菇F2代群体农艺性状的SSR关联分析. 章炉军,高成,于海龙,宋春艳,尚晓冬,谭琦,王瑞娟,张美彦. 2019

[11]小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析. 白鹏,程须珍,王丽侠,王素华,陈红霖. 2014

[12]芝麻SNP和InDel标记遗传多样性、群体结构及连锁不平衡分析. 魏利斌,苗红梅,李春,段迎辉,徐芳芳,张海洋. 2017

[13]273份水稻种质资源的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡分析. 董俊杰,曾宇翔,季芝娟,梁燕,杨长登. 2021

[14]关联分析在玉米遗传学研究中的应用. 赵曦,王荣焕,于永涛,王天宇,黎裕. 2008

[15]玉米耐盐基因ZmHKT1的序列变异分析. 姜志磊,姜昱,刘艳芝,蒋超,金峰学. 2015

[16]基于SSR标记的梨资源遗传多样性分析. 张妤艳,吴俊,张绍铃. 2008

[17]微卫星标记在鲟鱼分子遗传学研究中的应用. 刘伟,孔杰,王霞. 2017

[18]分子标记在鱼类中的应用研究进展. 孔杰,王金乐,关梅,杨兴. 2012

[19]贵州三叶木通遗传多样性及亲缘关系分析. 张雪,马玉华,仲伟敏. 2016

[20]贵州金荞麦种质资源遗传多样性ISSR研究. 邓蓉,王安娜,张定红,向清华. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序