苹果SLAF图谱构建及果锈基因QTL分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张朝红

作者： 张朝红;陈东玫;杨凤秋;赵同生;李扬;赵国栋;赵永波

作者机构：

关键词： 苹果;果锈;SLAF;遗传图谱;QTL分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 005 期

页码： 37-44

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了定位苹果果锈的QTL,鉴定果锈基因的遗传位点,以解析苹果果锈基因的分子遗传基础.以宫崎短枝富士*坂田津轻分离群体及其亲本为材料,基于SLAF-seq技术开发分子标签,并构建高密度遗传图谱,结合3个年份的田间表型数据,采用mapqtl进行果锈基因的QTL分析.结果表明,获得了522 122 315 reads(110.32 Gb)的测序数据,测序平均Q30为95.07%,平均GC含量为40.11%;开发了20 440个SLAF标签,7 309 729个SNP;构建了17个连锁群,4 075个上图标记,总图距为2 235.23 cM,平均图距达0.55 cM,上图标记的完整度为99.92%.共检测到了9个果锈相关的QTL,分别分布在Chr3、Chr9、Chr11、Chr15染色体上,标记距离为0~4.9 cM,贡献率为18.0%~85.5%.其中,检测到控制果锈的Qru-9、Qru-15、Qru-3的贡献率较高,可能是控制苹果果锈的关键位点.构建了苹果SLAF遗传图谱,获得了9个与果锈相关的QTL,研究结果对于苹果果锈及其相关基因的进一步挖掘与利用具有重要意义.

分类号： S661.1

  • 相关文献

[1]崇化大梨×新世纪梨F_1代分子遗传图谱的构建及两个果实性状的QTL分析. 王龙,杨健,王苏珂,李秀根. 2011

[2]梨遗传连锁图谱的构建及部分果实性状QTL的定位. 韩明丽,刘永立,郑小艳,杨健,王龙,王苏珂,李秀根,滕元文. 2010

[3]金冠苹果芽变新品种丰帅的选育. 杨丽媛,师忠轩,徐秀丽,高付永,闫忠业. 2012

[4]苹果遗传图谱的构建与QTL定位研究进展. 黄金凤,王冬梅,闫忠业,吕天星,王颖达,刘志. 2016

[5]蒺藜苜蓿、天蓝苜蓿、金花菜基因组SNP穿梭标记开发. 任海龙,魏臻武,陈祥. 2017

[6]基于SLAF-Super BSA技术的玉米萌发期耐冷性定位的初步研究. 曹士亮,于滔,董玲,刘宝民,王成波,李文跃,杨耿斌,武尔娜. 2021

[7]采用SLAF-seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点. 王伟,刘凡,任莉,徐理,陈旺,曾令益,黄炳文,方小平. 2016

[8]控制高粱分蘖与主茎株高一致性的基因定位. 王瑞,凌亮,詹鹏杰,于纪珍,楚建强,平俊爱,张福耀. 2019

[9]甜樱桃高密度连锁图谱的构建. 王晶,闫国华,张晓明,周宇,张开春. 2014

[10]葡萄果粒形状简化基因组关联分析. 张恒,刘众杰,樊秀彩,张川,崔力文,刘崇怀,房经贵. 2017

[11]采用SLAF - seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点. 王伟,刘凡,任莉,徐理,陈旺,曾令益,黄炳文,方小平. 2016

[12]苹果优质晚熟新品种-望香红. 闫忠业. 2014

[13]'阳光玫瑰'葡萄果锈发生规律调查与防治建议. 娄玉穗,尚泓泉,吕中伟,王鹏,张晓锋,吴文莹,张柯,樊红杰. 2020

[14]大果优质三倍体梨新品种——华幸. 王斐,方成泉,姜淑苓. 2014

[15]苹果果锈发生机制及防控技术研究进展. 李壮,厉恩茂,袁继存,安秀红,李敏,程存刚. 2015

[16]早熟大果型梨新品种——中梨4号. 李秀根. 2014

[17]苹果新品种——华月. 王强. 2014

[18]外源赤霉素对香蕉果皮解剖结构和化学组成的影响及果锈防治效应. 赵明,龙芳,莫天利,黄相,武鹏,何海旺,邹瑜. 2022

[19]西洋梨新品种-凯斯凯德. 冉昆,王少敏. 2015

[20]不同栽培管理措施对香蕉果锈发生的影响. 赵明,武鹏,龙芳,何海旺,黄相,莫天利,邹瑜. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序