四株不同宿主来源的ClassⅠ基因3型新城疫病毒全基因组序列测定及比较分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 金仕强

作者: 金仕强;孟春春;邓俊良;张向乐;仇旭升;谭磊;于圣青;左之才;丁铲

作者机构:

关键词: 新城疫病毒;ClassⅠ;全基因组序列;不同宿主来源

期刊名称: 病毒学报

ISSN: 1000-8721

年卷期: 2012 年 28 卷 04 期

页码: 394-402

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解析基因型相同但宿主来源不同的新城疫病毒的全基因组差异。本文采用RT-PCR方法分别获得4株(JS/3/09/Ch,ZJ/3/10/Ch,AH/2/10/Du,JS/9/08/Go)Class Ⅰ基因3型病毒的全基因组核苷酸序列,并与Gen-Bank中已公布的Class Ⅰ基因3型病毒全基因组序列进行比对分析。本实验4株病毒的基因组长度均为15 198bp,在基因组1 607~1 608位有6碱基的缺失,在2 381~2 382位有12碱基的插入,裂解位点为112 EQ/RQE/GRL117是标准弱毒特征。5株Class Ⅰ基因3型病毒之间全基因组同源性超过93%;而与Class Ⅱ弱毒株同源性最低只有72.2%;比较6个结构蛋白基因的同源性,NP基因的同源性最高(98.3%~96.4%),而P基因最低(96.1%~91.9%)。结果表明不同宿主来源的Class Ⅰ基因3型新城疫病毒在遗传信息方面差异不大,但NP/F/L基因的变异幅度较P/M/HN基因明显。

分类号: S852.659.5

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