香蕉TCP全基因家族的鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘京

作者： 刘京;吕前前;盛鸥;彭淼;钟晓红;邓贵明

作者机构：

关键词： 香蕉;TCP基因;基因家族;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 005 期

页码： 1427-1437

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TCP(Teosinte branched I,Cycloidea,Proliferating Cell Factors 1 和 2)基因家族是植物特有的转录因子.在植物生长发育过程中具有重要的调控作用.本研究基于香蕉基因组数据,利用生物信息学方法从香蕉基因组中鉴定出了 48个TCP家族基因,基于生物信息学进行分析,并利用RT-qPCR分析该基因家族在巴西蕉不同营养器官、生殖器官和果实发育的不同阶段及果实采后催熟过程中的表达情况.结果表明,香蕉MaTCP家族蛋白分子量在4.86~5.11 kD之间,48个TCP基因可以分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两类,香蕉MaTCP基因结构较为简单,内含子数目较少,大部分基因含有相同的motif 1.顺式元件分析发现,香蕉TCP家族基因的启动子序列中含多个非生物胁迫响应元件.qPCR结果表明,MaTCP22和MaTCP35在香蕉叶片高表达,MaTCP32在香蕉雌性器中高表达,MaTCP4、MaTCP6和MaTCP7在香蕉发育过程的果实中高表达.本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据,并为了解香蕉生长发育和果实采后催熟过程中的分子机制提供了提供数据参考.

分类号： S668.1

  • 相关文献

[1]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020

[2]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[3]香蕉高亲和性钾转运蛋白(HAK)家族全基因组鉴定及表达. 田娜,王斌,伍俊为,武欢,刘嘉鹏,刘范,邓贵明,黄玉吉,程春振. 2022

[4]香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良,胡会刚. 2016

[5]香蕉SPS基因家族的系统进化分析. 陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清. 2021

[6]香蕉β-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,李伟才,魏永赞,王弋,郑雪文,胡会刚. 2016

[7]香蕉ACS基因家族的系统进化分析. 李伟才,张纯,魏永赞,王弋. 2017

[8]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[9]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021

[10]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021

[11]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[12]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

[13]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[14]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

[15]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[16]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[17]石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 骆翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬丹,唐丽颖. 2020

[18]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021

[19]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[20]苹果TIFY家族基因鉴定及其在虫害胁迫下的表达分析. 梅闯,张小燕,闫鹏,艾沙江·买买提,冯贝贝,马凯,韩立群,董连新,王继勋. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序