红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李荣妮

作者： 李荣妮;王赛赛;田仲;孙砚胜;张博;张欣

作者机构：

关键词： 红望天眼金鱼;体色变迁;转录组测序;差异表达基因;信号通路

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN： 2095-1388

年卷期： 2022 年 37 卷 002 期

页码： 191-201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探索红望天眼金鱼Carassius auratus的变色机制,采用RNA-Seq高通量测序技术,对红望天眼金鱼(145日龄,体长6 cm)由灰色、过渡色到橙红色3个变色阶段进行了转录组学分析.结果表明:共得到过滤后碱基量57.8 Gb,构建了新转录本并预测新基因1629个,在两两组比较的差异表达基因群中分析出3个变色组共有差异表达基因25个;差异表达基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析显示,差异基因主要富集到免疫反应、细胞增殖与凋亡和黑色素等相关通路;根据转录组比较分析结果和实际生产经验观察积累,初步推测红望天眼金鱼变色的生理机制是红望天眼金鱼变色初期黑色素细胞大量增殖,期间发生免疫炎症反应,随后黑色素细胞开始逐渐凋亡,同时其他色素细胞则逐渐增殖分化,直至完全取代黑色素细胞,完成变色过程.本研究初步分析出了红望天眼金鱼的皮肤变色机制,研究结果可为进一步开展调控金鱼变色的功能基因试验和金鱼变色的分子机理研究提供科学参考.

分类号： S963.73

  • 相关文献

[1]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023

[2]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022

[3]雏鸡红细胞免疫相关基因差异表达的时序性研究. 贾悦,李月健,喻进,张晨亮,李娜娜,卢晓晓,张宁,李欣,张鼎,郝卫芳,马海利,高文伟,赵宇军,高诗敏,李建慧,李桂兰,闫芳,韩凌霞,宁官保,田文霞. 2015

[4]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019

[5]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018

[6]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020

[7]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[8]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021

[9]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[10]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023

[11]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[12]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019

[13]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015

[14]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022

[15]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022

[16]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017

[17]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[18]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[19]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024

[20]基于转录组测序筛选大口黑鲈食性驯化相关基因和SNP标记. 邵嘉棋,杜金星,雷彩霞,李胜杰,董传举,张猛,李学军. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序