东北野生大豆核心种质单核苷酸多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟爽

作者： 孟爽;赵洪锟;袁翠平;尹光;刘晓冬;王玉民;董英山;李建东

作者机构： 沈阳农业大学农学院;吉林省农业科学院农业生物技术研究所;深圳市高级中学

关键词： 野生大豆;核心种质;SNP;Indel;遗传多样性

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2015 年 34 卷 02 期

页码： 185-190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对196个东北野生大豆核心种质的NRT2、Asp AT2和CPK13三个基因片段进行单核苷酸扫描,共检测到94个SNPs位点及10个插入/缺失位点(Indel),碱基转换和颠换平均比例约2∶1。稀有SNPs位点(<10%)39个,比率约为41.5%。196份核心种质平均多态性位点比例约为74%,Shannon's指数是0.366,多样性指数为0.241;不同纬度群体的平均多样性指数随纬度下降逐渐升高,在44°N时达到峰值,然后随纬度降低缓慢下降,多样性指数变化呈近似正态曲线模式。初步推测N 42°~N45°区域为东北野生大豆的多样性中心。

分类号： S565.1

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