普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参不同组织基因组DNA的MSAP研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 左之良

作者： 左之良;谭杰;吴彪;陈四清;高菲;燕敬平;王爽;孙慧玲

作者机构：

关键词： 刺参;MSAP;CCGG位点;甲基化水平

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2016 年 37 卷 03 期

页码： 93-100

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究分别以普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参基因组DNA为实验材料,应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术对刺参体壁、呼吸树和消化道3个组织的DNA甲基化水平和甲基化模式进行了研究,初步探讨了DNA甲基化对刺参组织间基因特异性表达的影响。结果显示,筛选得到的9对引物组合能够在普通刺参和白刺参两个群体中得到稳定扩增,在两群体刺参中分别检测到5932和5208个位点,均以未甲基化位点为主,普通刺参和白刺参未甲基化位点数分别为4317和3944,分别占总扩增条带数的72.78%和75.73%。普通刺参体壁的甲基化水平为31.07%,呼吸树为23.36%,消化道为26.34%;白刺参中体壁的甲基化水平为29.88%,呼吸树为23.25%,消化道为19.45%,由此可见,体壁的甲基化率在两群体中是最高的。普通刺参和白刺参同一组织间的甲基化水平和甲基化模式不同,同一群体体壁、呼吸树和消化道不同组织间的甲基化水平和模式也不同。甲基化在普通刺参和白刺参组织分化和发育过程中可能发挥着十分重要的作用。在检测的3个组织中,CCGG序列的全甲基化位点较半甲基化位点多。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]利用分子标记分析油菜在种子萌发过程中和盐胁迫条件下的DNA遗传变异和甲基化状态变化. 伍晓明,陆光远,陈碧云,高桂珍,许鲲. 2006

[2]油菜杂种优势形成过程中基因组DNA甲基化模式研究. 齐兴,王磊,范云六,张春义. 2007

[3]不同倍性鸭梨基因组DNA甲基化水平与模式分析. 王春国,胡宝全,方成泉,林盛华. 2007

[4]NaCl胁迫下棉花基因组DNA胞嘧啶甲基化分析. 赵云雷,叶武威,王俊娟,樊保香. 2008

[5]基因组;基因表达与饲料. CliffordAAdams,岳洪源,齐广海,李海涛. 2008

[6]不同倍性西瓜基因组DNA甲基化水平与模式的MSAP分析. 王春国,古瑜,陈成彬,焦定量,薛振毅,宋文芹. 2009

[7]火龙果MSAP体系的优化及组培苗DNA甲基化检测. 刘鹏飞,乔光,刘涛,彭志军,蔡永强,晓鹏. 2016

[8]氮胁迫下高羊茅基因组DNA甲基化的MSAP分析. 王小利,王茜,舒健虹,蔡一鸣,刘彬,吴佳海. 2015

[9]干旱胁迫对老芒麦DNA表观遗传变化的MSAP分析. 闫伟红,马玉宝,陈云,王凯,孟庆伟,张晶然. 2016

[10]两种扇贝杂交和自交家系早期生长及甲基化的比较分析. 吴彪,杨爱国,刘志鸿,周丽青,程鹏,于涛. 2012

[11]乌珠穆沁羊不同组织基因组DNA甲基化状态的MSAP分析. 何小龙,付绍印,李蓓,祁云霞,王标,特日格勒,郝晨芳,达赖,刘永斌,荣威恒. 2017

[12]贵州不同海拔地区光叶紫花苕DNA甲基化多态性分析. 王子苑,舒健虹,王小利,尚以顺. 2020

[13]入侵植物黄顶菊不同器官和不同发育阶段DNA表观遗传多样性变化特征. 张思宇,全志星,田佳源,杨殿林,刘红梅,王慧. 2019

[14]一年生辣椒(Cpsicum annuum L.)与中华辣椒(Cpsicum chinense Jacquin)DNA甲基化多样性分析. 李涛,徐小万,李颖,李明珠,王恒明,徐晓美,罗少波. 2014

[15]橡胶树MSAP反应体系的建立及其对无性系DNA的甲基化分析. 吴春太,李维国,黄华孙. 2011

[16]不同生态区同一基因型烤烟表观遗传的MSAP分析. 李辉,孙焕良,李德芳. 2013

[17]桃甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术体系的建立. 蔡志翔,沈志军,严娟,马瑞娟,俞明亮. 2016

[18]基于MSAP和SSR标记的高粱甲基化连锁群LGC、LGD的构建. 段永红,张旭,柳青山,孙毅. 2018

[19]玉米杂交种及其亲本基因组胞嘧啶甲基化水平研究. 仪治本,孙毅,牛天堂,梁小红,刘龙龙,闫敏,赵威军. 2005

[20]高粱基因组DNA胞嘧啶甲基化在杂交种和亲本间差异研究. 仪治本,孙毅,牛天堂,梁小红,刘龙龙,赵威军,李炳林. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序