扁蓿豆冷诱导基因差异表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张宇

作者: 张宇;石凤翎;云娜;高霞;伊风艳;蔡丽艳

作者机构:

关键词: 扁蓿豆;冷诱导;cDNA-AFLP;差异表达

期刊名称: 西北植物学报

ISSN: 1000-4025

年卷期: 2013 年 33 卷 01 期

页码: 66-71

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以直立型扁蓿豆幼苗为试验材料,采用cDNA-AFLP技术分析扁蓿豆在低温胁迫诱导下的基因表达差异。结果显示,利用筛选的64对引物组合,对0℃低温处理3~5叶期扁蓿豆幼苗的叶片cDNA进行扩增,共获得549条差异表达的转录衍生片段(TDFs)。选取上调表达较好的43条片段进行克隆、测序、Blastx比对和功能分析,其中32个TDFs的蛋白序列与基础代谢、信号转导、转录因子、防御等功能有关,11个TDFs为假设蛋白、未知蛋白或没有找到一致序列。利用荧光定量PCR对3种不同上调表达差异片段进行验证,结果可从数值上更准确地显示差异片段在低温胁迫过程中的相对表达量。

分类号: S541.9

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