水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘源
作者: 刘源;张秀妍;徐妙云;郑红艳;邹俊杰;张兰;王磊
作者机构:
关键词: 水稻;干旱胁迫;small RNA;转录组;已知miRNA;新miRNA;靶基因
期刊名称: 中国农业科技导报
ISSN:
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 23-32
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个。干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs。15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子。预测到miRNAs靶基因4 537个,并进行了功能注释和富集分析。这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源。
分类号: S511
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