盐碱胁迫下不同抗性杨树品种转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李文颖
作者: 李文颖;李晓宇;杨成超
作者机构:
关键词: 杨树;盐碱胁迫;转录组测序;差异基因
期刊名称: 中南林业科技大学学报
ISSN: 1673-923X
年卷期: 2025 年 45 卷 002 期
页码: 122-130
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】研究不同抗性杨树品种响应盐碱胁迫的转录水平,挖掘杨树耐盐碱相关基因,为后续深入探讨杨树响应盐碱胁迫的分子机制及后续遗传转化提供理论支撑。【方法】以杨树耐盐碱品种‘辽胡1号’和盐碱敏感品种‘中辽1号’为材料,采用盆栽法,加入 NaHCO3溶液模拟盐碱胁迫,利用转录组测序技术、生物信息学等方法分析盐碱胁迫下不同抗性杨树品种的转录水平,筛选与盐碱胁迫相关的差异表达基因,随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR试验,验证转录组数据的准确性。【结果】转录组测序结果表明,盐碱胁迫下不同抗性杨树品种之间共获得5 273个差异表达基因,其中上调表达2 709个,下调表达2 564个。GO分析结果发现,共有4 203个差异基因被注释到3大类37条通路中。KEGG分析结果发现,共有3 616个差异基因被注释,差异基因显著富集在植物信号转导途径(植物与病原体相互作用、植物激素信号转导)、代谢途径(淀粉与蔗糖代谢、碳代谢)和生物合成途径(苯丙素的生物合成、氨基酸的生物合成)。盐碱胁迫下MYB、ABC、WRKY、bHLH是差异基因较多的基因家族,筛选出CBL4、SOD2、bHLH35、ABCC10、CYP736A12、P5CS等差异基因表达显著上调。qRT-PCR结果验证转录组数据结果可靠。【结论】本研究通过转录组测序技术对盐碱胁迫下不同抗性杨树品种进行比较分析,挖掘出与耐盐碱性相关差异表达基因,为后续基因克隆和遗传转化奠定理论基础。
分类号: S792.11
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