玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王延召

作者： 王延召;周波;韩小花;黄保;鲁晓民;程军玲;王淑凤;聂利红

作者机构：

关键词： 玉米;GATA基因家族;全基因组鉴定;热胁迫;基因表达

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2020 年 49 卷 011 期

页码： 19-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础.结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX2 CX18 CX2 C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构.热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个(Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135),B组2个(Zm00001d011771、Zm00001d034751),C组2个(Zm00001d036494、Zm00001d014656);下调的基因有2个,均属于B组(Zm00001d016361和Zm00001d009193).说明上调表达的这9个GATA基因在应答热胁迫过程中可能发挥重要作用.

分类号： S513

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