利用SLAF-seq简化基因组测序技术对驴基因组进行测序分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖海霞
作者: 肖海霞;阿布来提·苏来曼;托乎提·阿及德;努尔尼萨·莫拉尼亚孜;帕热哈提江·吾甫尔;王琼;张国庭;谢立荣;苏玲玲;买买提·克玉木;田可川;刘武军
作者机构:
关键词: 疆岳驴;SLAF-seq;测序分析
期刊名称: 畜牧业环境
ISSN: 2096-6188
年卷期: 2021 年 021 期
页码: 27-28
摘要: 本文利用SLAF-seq简化基因组测序技术,通过选择驴基因组预测电子酶切组合方式,最终使用RsaI+EcoRV-HF?进行酶切,酶切效率为95.24%,将长度为364~394bp的测序序列定义为一个SLAF标签,预测了到234762个SLAF标签.通过生物信息学分析获得SLAF标签数为1,416,014个SLAF标签数(900,598个多态性SLAF标签),获得的群体SNP为4,887,196个,为与疆岳驴乳用性状做全基因组关联分析奠定了基础.
分类号:
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
和田羊FecB基因多态性与产羔数及生长性状关联分析
作者:杨存明;田可川;张文浩;刘黎;阿布力克木·阿地力;李雪;梁贵晨;赵志文;李超;高伟;黄锡霞;田月珍
关键词:和田羊;FecB;产羔数;生长性状
-
基于线虫模型的流苏石斛和鼓槌石斛神经保护作用研究
作者:刘鹏飞;陈程;王凤忠;刘佳妮;杨洋;王琼;何汶璐;孙晶;邹翔;范蓓
关键词:鼓槌石斛;流苏石斛;α-突触核蛋白;神经保护
-
胡椒提取物改善慢性束缚应激小鼠抑郁样行为的潜在机制研究
作者:贯东艳;张米佳;侯志颍;王佳音;于佳玮;范蓓;谢辉;段宙位;白亚娟;吴宏红;王凤忠;王琼
关键词:胡椒;抑郁症;神经保护;网络药理学
-
补喂精料补充料对疆岳驴空怀母驴育肥效果的影响
作者:王琼;张国庭;托乎提·阿及德;帕热哈提江·吾甫尔;阿布来提·苏来曼;努尔尼萨·莫拉尼亚孜;阿米那木·买买提;依布热依木·吾布力;肖海霞
关键词:空怀;精料补充料;体重;受胎率
-
半纤维素分解菌群HMC的微生物群落结构及功能
作者:高秀清;王琼;罗轶伦;吕育财;崔明宇;陈永伦;张冬冬;肖园;范淄亭;王浩伟;王轶;郭鹏
关键词:半纤维素;微生物群;降解;微生物群落结构;宏基因组学;还原糖;挥发性脂肪酸
-
日粮中添加不同益生菌水平对肉牛生产性能和肠道菌群的影响
作者:买买提·克玉木;曹宏斌;闫向民;张金山;马桢
关键词:益生菌;肉牛;生产性能;肠道菌群
-
基于网络药理学和实验验证探究酸枣仁复方治疗抑郁症的作用机制
作者:郑涵文;刘昕玥;赵海燕;王佳音;罗福龙;范蓓;Alberto Carlos Pires Dias;王凤忠;王琼
关键词:网络药理学;酸枣仁复方;抑郁症;炎症因子