利用SLAF-seq简化基因组测序技术对驴基因组进行测序分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖海霞
作者: 肖海霞;阿布来提·苏来曼;托乎提·阿及德;努尔尼萨·莫拉尼亚孜;帕热哈提江·吾甫尔;王琼;张国庭;谢立荣;苏玲玲;买买提·克玉木;田可川;刘武军
作者机构:
关键词: 疆岳驴;SLAF-seq;测序分析
期刊名称: 畜牧业环境
ISSN: 2096-6188
年卷期: 2021 年 021 期
页码: 27-28
摘要: 本文利用SLAF-seq简化基因组测序技术,通过选择驴基因组预测电子酶切组合方式,最终使用RsaI+EcoRV-HF?进行酶切,酶切效率为95.24%,将长度为364~394bp的测序序列定义为一个SLAF标签,预测了到234762个SLAF标签.通过生物信息学分析获得SLAF标签数为1,416,014个SLAF标签数(900,598个多态性SLAF标签),获得的群体SNP为4,887,196个,为与疆岳驴乳用性状做全基因组关联分析奠定了基础.
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