长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王旭歌

作者: 王旭歌;何勇凤;吴兴兵;杨德国

作者机构:

关键词: 短颌鲚;D-loop;遗传多样性;遗传分化;地理群体

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 106-113

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探明长江中下游不同湖泊中短颌鲚(Coilia brachygnathus)遗传多样性水平和遗传分化程度,以洞庭湖、长湖、巢湖3个地理群体作为研究对象,采用线粒体控制区序列为分子标记,分别应用软件Dna SP 5.0、Arlequin3.1.1、MEGA5.0和Network 5.1进行了遗传参数统计和单倍型间分子变异分析(AMOVA),构建邻接系统树及单倍型网络图。对长江中下游短颌鲚野生群体的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果显示,用来分析的1 236 bp D-loop区序列中共90个变异位点,54个简约信息位点。长江中下游3个地理群体中共发现58个单倍型,单倍型多样性(h)范围0.949~0.982,核苷酸多样性范围0.004 99~0.006 21,说明长江中下游3个湖泊短颌鲚地理群体具有较高的遗传多样性水平。3个短颌鲚地理群体遗传分化指数(Fst)为0.265 95,呈现出中等程度的分化水平,主要表现在巢湖群体与其他群体之间处于中等程度分化水平。依据遗传距离构建系统发育树及单倍型网络图也出现相类似结果。

分类号: S917.4

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