准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8序列生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 姚怀兵

作者: 姚怀兵;马强;李玲;闫慧;郝泽林;岳海涛;王玉琢;马英俊;毋状元;汪亮;陈钢粮;杨洁;华实

作者机构:

关键词: 双峰驼;DGAT1基因;外显子8;蛋白质;生物信息学分析

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医(上半月)

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2022 年 011 期

页码: 122-126,141-142

收录情况: 北大核心

摘要: 为了研究准噶尔双峰驼二酰基甘油酰基转移酶1(diacylgycerol acyltransferase 1,DGAT1)基因外显子8编码区的理化性质与结构,以及为寻找与双峰驼泌乳性状相关的分子遗传标记提供基础资料,试验对准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8进行PCR扩增,利用生物信息学方法对DGAT1蛋白结构、理化性质及信号肽、跨膜位置等进行分析,并比较了准噶尔双峰驼与其他物种DGAT1氨基酸序列的进化关系.结果表明:准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8扩增产物大小为421 bp,编码484个氨基酸,有1个保守域,位于62~468位氨基酸处.DGAT1蛋白属于亲水性蛋白,且为不稳定的非经典分泌蛋白.二级结构中,α-螺旋占48.35%,延伸链占14.46%,β-转角占4.13%,无规则卷曲占33.06%,存在9个蛋白跨膜结构区域.骆驼科的双峰驼、单峰驼和野骆驼的DGAT1蛋白独立成支,与牛DGAT1蛋白的分子进化距离相距较远.准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8序列及蛋白质结构与牛DGAT1蛋白卷曲方式、立体空间结构方面基本一致.说明DGAT1基因在物种间变异不大.

分类号: S824%Q753

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