中国南瓜内参基因18S rRNA的克隆及其引物开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱海生

作者： 朱海生;王彬;陈敏氡;李永平;张前荣;刘建汀;李大忠;吴卫东;温庆放

作者机构：

关键词： 中国南瓜;18S rRNA;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-9387

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 118-125

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆获得中国南瓜18SrRNA,并设计合适的荧光定量PCR内参,为开展中国南瓜重要功能基因的表达模式和调控机制研究奠定基础。【方法】以中国南瓜‘密本’品种的基因组DNA为模板,通过PCR方法克隆中国南瓜18SrRNA基因序列,再利用Primer Premier软件设计荧光定量PCR引物,对该内参基因在中国南瓜不同组织、生长阶段及非生物胁迫条件下的表达稳定性进行检测。【结果】首次克隆得到中国南瓜18SrRNA基因序列,其长度为1 857bp,GenBank登录号为KM979454,该基因与西瓜、西葫芦等瓜类蔬菜18SrRNA基因同源性大都在90%以上;以中国南瓜内参基因18SrRNA核苷酸全长序列为基础设计1对荧光定量PCR引物,以中国南瓜果肉总RNA逆转录的cDNA第一链为模板进行PCR扩增,该引物扩增的片段大小为132bp,扩增效率高,特异性强;18SrRNA基因在中国南瓜不同组织、生长发育阶段及非生物胁迫条件下均能稳定表达。【结论】克隆获得中国南瓜18SrRNA基因,该基因适合在中国南瓜基因表达研究中作为内参基因。

分类号： S642.1

  • 相关文献

[1]丝瓜18S rRNA基因克隆及其作为内参基因的应用. 朱海生,陈敏氡,温庆放,蓝新隆,李永平,王彬,张前荣,吴卫东. 2016

[2]紫花苜蓿18S rRNA基因的克隆及内参基因表达稳定性评价. 付媛媛,穆春生,高洪文,李俊,王学敏. 2014

[3]民猪外周血单核细胞实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 马红,刘宇,汪亮,王文涛,吴赛辉,何鑫淼,刘娣. 2017

[4]大白菜-结球甘蓝易位系实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 崔菲菲,孟川,王彦华,赵建军,陈雪平,申书兴,顾爱侠. 2018

[5]稻粒黑粉病菌实时荧光定量PCR内参基因筛选. 盘林秀,王娜,王爱军,夏园,付成林,殷得所,郑爱萍. 2018

[6]银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证. 苏西娅,石元豹,杨晓明,汪贵斌,曹福亮. 2019

[7]龙眼果实发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 王淳璐,王彬,寇译丹,胡文舜,陈秀萍. 2021

[8]西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选. 周琳,蔡友铭,杨柳燕,赵冰雪,李芳,张永春. 2020

[9]杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证. 刘小飞,于波,黄丽丽,孙映波. 2020

[10]不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选. 潘红,赖呈纯,张静,黄贤贵,林玉玲,赖钟雄. 2019

[11]栽培远志qRT-PCR内参基因筛选与P450s基因的时空表达分析. 李娟,孔冉冉,梅月菊,张福生,田洪岭,秦雪梅,杜晨晖,马存根. 2019

[12]萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 梁锦,刘海婷,钟荣,李昊,尹冬梅,刘翔,秦巧平,张志国,段可,倪迪安. 2020

[13]澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 杨倩,杨子平,周娅丽,陈东泉,刘恒. 2020

[14]近零磁场下粘虫雌蛾内参基因转录表达稳定性评价. 闫蒙蒙,张蕾,程云霞,江幸福. 2021

[15]柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选. 梁蕤,徐雷锋,毕蒙蒙,王静,唐玉超,郝泽慧,刘一洁,杨盼盼,明军,杜方. 2023

[16]杂交兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,樊荣辉,吴建设. 2018

[17]钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选. 马璐琳,段青,崔光芬,杜文文,贾文杰,王祥宁,王继华,陈发棣. 2021

[18]秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 侯天泽,易双双,张志群,王健,李崇晖. 2022

[19]橡胶草实时荧光定量PCR内参基因评价. 覃碧,潘敏,余海洋,杨玉双,甘霖. 2016

[20]镰刀菌酸胁迫下节瓜实时荧光定量PCR分析内参基因的选择. 张金平,何晓明,江彪,谢大森,彭庆务,王永飞,马三梅. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序