基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 鲁翠云

作者： 鲁翠云;孙志鹏;曹顶臣;耿龙武;那荣滨;吴学工;郑先虎

作者机构：

关键词： 梭鲈;线粒体COⅠ基因;野生群体;遗传结构

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2024 年 48 卷 001 期

页码： 82-92

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解梭鲈种群的遗传结构,实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因部分序列分析了中国 6 个和中亚 2 个群体的遗传差异,并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较.结果在 640 bp的COⅠ基因序列中检测到 5 个变异位点,定义了 7 种单倍型,发现Hap1 为 8 个梭鲈群体的共享单倍型,且与欧洲群体的HapA相同,在中国群体所占比例(93.36%)高于中亚群体(72.58%)和欧洲群体(53.85%);Hap2 和Hap3 是中国群体的特异单倍型,而Hap4~Hap7 为中亚群体的特异单倍型.单倍型序列的聚类图和网络图均显示Hap1/A为梭鲈群体的原始单倍型,中国和中亚群体的特异单倍型相对于原始单倍型仅有1~2 个位点的变异,属于Hap1/A的亚型,与欧洲群体的特异单倍型具有较大的差异.每个群体检测到 1~4 种单倍型,斋桑湖(ZS)群体单倍型最多,而中国的腾格里湖(NX)、兴凯湖(XK)和鸭绿江(YJ)群体仅有 1 个单倍型(Hap1);塔什干(TS)群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)最高(Hd=0.514±0.069;π=0.000 79±0.000 11),其次是ZS群体,而中国梭鲈群体的多样性参数较低.AMOVA分析结果显示,梭鲈群体间遗传变异占20.74%,群体间遗传分化程度较高(0.15≤Fst=0.207 36<0.25),TS群体与ZS群体和中国群体间的遗传分化极大(Fst>0.25),中国群体中仅黑河(HH)群体与其他群体的遗传分化较大,而中国其他 5 个群体间无遗传分化.基于群体间遗传距离的系统进化树显示,来自中国的 6 个梭鲈群体与哈萨克斯坦的ZS群体聚为一支,而乌兹别克斯坦的TS群体独立为一支.研究结果为梭鲈群体的繁殖及放流管理提供了参考.

分类号： Q347%S917.4

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