少孢节丛孢菌Aoz1基因调控区的发掘及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王新芳

作者： 王新芳;尹相吉;聂福贵;陈湘江;郭宏年;梁萌;罗小平;钱英红;郭少平;杨晓野;王瑞

作者机构：

关键词： 少孢节丛孢菌;Aoz1基因;PCR;启动子;生物信息学分析;启动子预测

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2018 年 23 期

页码： 21-26

收录情况： 北大核心

摘要： 为了确定少孢节丛孢菌内蒙古株丝氨酸蛋白酶Aoz1基因的潜在启动子区,试验采用透析膜培养的方法培养出少孢节丛孢菌内蒙古株并提取基因组DNA,与NCBI上Aoz1基因进行比对,选定Aoz1基因上游侧翼长度为2 000 bp的序列(命名为AP1)并据此设计引物,用PCR法扩增该序列并构建至平末端载体后测序,使用启动子在线预测软件Web Promoter Scan Service、NNPP以及CpG岛预测软件EMBOSS对AP1进行生物信息学分析。结果表明:所提取的基因组DNA完整性良好;成功构建出重组平末端质粒PEASY-AP1-Blunt,测序结果正确;通过相应软件预测出AP1含有的启动子基本元件,如TATA框、转录起始位点(TSS位点),以及参与Aoz1基因表达调控的转录因子结合位点Sp1、GHO、E2F、T-Ag和GCF等,同时确定了CpG岛的Obs/Exp值与GC含量的百分比分布。说明AP1序列具有启动子的基本结构和特点,初步确定了少孢节丛孢菌Aoz1基因的潜在启动子区。

分类号： S855.9`Q78

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