湖北地区克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区ORF14/15、ORF23/24基因序列比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨星

作者： 杨星;刘文枝;马杰;周勇;范玉顶;曾令兵

作者机构：

关键词： 克氏原螯虾(Procambarus;clarkii);白斑综合征病毒;ORF14/15;ORF23/24;序列分析

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2017 年 47 卷 005 期

页码： 64-71

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 试验扩增、克隆了在湖北地区采集的19份克氏原螯虾(Procambarus clarkii)白斑综合征病毒(White spot syndrome virus,WSSV)阳性样品的变异区ORF14/15和ORF23/24基因,通过测序比较分析了湖北各WSSV毒株与Gen Bank公布的标准毒株间在变异区ORF14/15及ORF23/24基因的差异性.结果显示,19份WSSV阳性样品中有部分样品在变异区扩增出ORF14/15、ORF23/24基因片段,变异区基因序列分析发现,与GenBank已公布的标准毒株相比,存在大片段缺失.在变异区ORF14/15,有3个毒株扩增出1 442 bp的片段,4个毒株扩增出630 bp的片段,基于变异区ORF14/15构建的系统进化树显示,这些毒株归属两个不同的分支.在变异区ORF23/24,有2个毒株扩增出大小为2 096 bp的片段,进化分析发现这2个毒株在变异区ORF23/24的遗传距离较近.

分类号： S945.4

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