文献类型： 中文期刊
第一作者： 刘星晨
作者： 刘星晨;冯胜泽;李学然;巩校东;李志勇;谷守芹;董金皋
作者机构：
关键词： 玉米大斑病菌;GATA转录因子家族;结构分析;系统进化;基因表达
期刊名称： 农业生物技术学报
ISSN： 1674-7968
年卷期： 2017 年 12 期
页码： 2018-2026
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： GATA转录因子家族广泛存在于植物病原真菌中,并参与调控多种生物过程,但在玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)中尚未见相关报道。本研究借助生物信息学技术手段,在玉米大斑病菌全基因组数据库中鉴定了5个GATA转录因子家族成员,分别命名为St GATA1~St GATA5,这些基因分别散布在基因组5条不同的scaffold链上。对其预测编码蛋白进行理化性质分析发现,St GATA3呈酸性,其余4个转录因子对应蛋白均呈碱性,且这5种蛋白都属于不稳定蛋白,其编码蛋白的氨基酸数目在278~1 080之间;对蛋白的保守结构域分析发现,该类转录因子都存在Zn F-GATA结构域,其中St GATA3和St GATA4都含有PAS结构域,St GATA4还含有两个PAC结构域;系统进化分析表明,St GATA2与番茄叶霉病菌(Passalora fulva)、荨麻青霉(Penicillium urticae)及构巢曲霉(Aspergillus nidulans)聚为一簇,另外4种大斑病菌GATA转录因子(St GATA1,St GATA3,St GATA4,St GATA5)聚为一类;进一步利用q RT-PCR技术对GATA转录因子家族基因的表达模式进行初步分析,结果发现St GATA1和St GATA3在菌丝时期的表达水平高于其他时期;St GATA2在侵入丝时期的表达量显著高于其他时期,并且在菌丝及分生孢子阶段都有较高的表达水平;St GATA4和St GATA5都在菌丝和分生孢子时期有较高表达量,其余时期表达水平较低(P<0.05)。本研究结果将为深入揭示玉米大斑病菌GATA转录因子家族的功能及探寻病害防治新途径提供参考与借鉴。
分类号： S435.131.4
- 相关文献
[1]玉米大斑病菌Homeobox转录因子家族全基因组鉴定及其表达规律分析. 赵洁,赵立卿,巩校东,冯胜泽,刘星晨,郑亚男,李志勇,孙海月,王冬雪. 2017
[2]玉米大斑病菌MAPK超家族的全基因组鉴定及途径模型建立. 巩校东,张晓玉,田兰,王星懿,李坡,张盼,王玥,范永山,韩建民,谷守芹,董金皋. 2014
[3]仿刺参SARM基因的克隆、表达和功能研究. 孙红娟,陈仲,贺迪,高杉,王摆,关晓燕,蒋经伟,董颖,周遵春. 2021
[4]番木瓜eIF(iso)4E基因克隆及其结构和表达分析. 言普,沈文涛,高新征,李亚丽,周鹏. 2009
[5]北京油鸡ADSL基因的克隆、表达及其结构与功能分析. 刘长青,刘帅,包阿东,陆涛峰,吴宏梅,张洪海,唐学玺,关伟军,马月辉. 2008
[6]百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析. 丘日光,张天缘,杨仕梅,宋莉,赵德刚. 2019
[7]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023
[8]萝卜全基因组中LBD基因家族成员的鉴定与分析. 刘同金,张晓雪,张晓辉,王海平,邱杨,宋江萍,李锡香. 2019
[9]梨CBL基因家族全基因组序列的鉴定及非生物胁迫下的表达分析. 许园园,蔺经,李晓刚,常有宏. 2015
[10]普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析. 孙亭亭,张磊,陈乐,龚达平,王大伟,陈雅琼,陈蕾,孙玉合. 2016
[11]4个禾本科植物NAC基因家族的系统进化及其在玉米中的干旱表达谱分析. 李丽华,郭颖彬,魏昕. 2022
[12]藜芦bHLH转录因子分析鉴定. 寇呈熹,佟金泉,马瑞,孙伟,薛哲勇,麻鹏达. 2022
[13]普通烟草LBD基因家族的全基因组序列鉴定与表达分析. 孙亭亭,龚达平,张磊,陈雅琼,赵维,向小华,孙玉合. 2016
[14]玉米大斑病菌ATMT突变体库的构建及其分析. 王梅娟,李坡,吴敏,范永山,谷守芹,董金皋. 2012
[15]玉米大斑病菌Stgb-1基因正反义表达载体的构建与功能初探. 郝志敏,李丽花,李志勇,韩建民,陆晴,佟文跃,董金皋. 2010
[16]玉米大斑病菌钙/钙调素依赖性蛋白激酶(CaMK)基因家族的鉴定与表达模式分析. 吴迪,赵梓彤,李志勇,杨峥,檀迎会. 2015
[17]玉米大斑病菌转录因子StSte12的活性及其对酵母生长的功能互补分析. 吴敏,谷守芹,李坡,王梅娟,张长志,范永山,韩建民,董金皋. 2012
[18]磷脂酶C特异性抑制剂U-73122对玉米大斑病菌分生孢子萌发及毒素活性的影响. 郝志敏,郝杰,李志勇,董金皋. 2010
[19]玉米大斑病菌有性杂交后代的交配型与寄生适合度分化. 郭丽媛,贾慧,曹志艳,谷守芹,孙淑琴,董金皋. 2013
[20]玉米内生芽胞杆菌的抗菌活性物质及其拮抗玉米大斑病菌机理的初步研究. 候美玲,辛媛媛,郝志敏,曹志艳,申珅,张韶茹,董金皋. 2012
作者其他论文 更多>>
-
谷瘟病、谷锈病混合发生区的药剂防控与产量损失
作者：马继芳;王永芳;白辉;张梦雅;刘佳;李志勇;董志平
关键词：谷瘟病;谷锈病;混合发生;防控;产量损失
-
白屈菜红碱可湿性粉剂的研发及对水稻激素的影响
作者：韦庆慧;宋伟丰;师正浩;李志勇;潘亚清
关键词：白屈菜红碱;可湿性粉剂配方;稻曲病;植物激素
-
3种扁蓿豆叶和茎解剖特征比较及耐盐性评价
作者：朱琳;李鸿雁;郭茂伟;李志勇
关键词：扁蓿豆;叶片解剖形态;茎解剖形态;耐盐性
-
紫花苜蓿根际土壤真菌和不同部位内生真菌的菌群组成及多样性分析
作者：强晓晶;刘磊;黄帆;李志勇
关键词：紫花苜蓿;内生真菌;真菌多样性;优势菌属
-
抗倒伏高产玉米新品种'金岭青贮17'的选育
作者：刘倩;李志勇;金维波;杨晓东;何为平;赵淑芬;武自念
关键词：全株玉米青贮;杂交育种;抗倒伏;品种选育
-
内源激素对扁蓿豆荚果开裂影响的研究
作者：刘万鹏;郭茂伟;朱琳;李悦煊;李志勇;李鸿雁
关键词：扁蓿豆;内源激素;荚果裂荚
-
中国北方玉米产区玉米大斑病菌交配型组成及其分布分析
作者：王超红;张璐;郭正宇;阎晓光;刘欣芳;刘宁;曹志艳;董金皋
关键词：玉米大斑病菌;交配型（MAT）;分布
