不同硬度西瓜果皮的转录组测序及相关基因表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张敬敬

作者： 张敬敬;李冰;史宇凡;高秀瑞;潘秀清;宋雪;武彦荣

作者机构：

关键词： 西瓜;果皮硬度;转录组;差异表达基因;苯丙烷;木质素

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2022 年 37 卷 003 期

页码： 44-52

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为解析西瓜果皮硬度不同的相关分子机制,挖掘西瓜果皮硬度相关的关键基因提供理论基础,以生育期相似但果皮硬度差异显著的高硬度(901)4-1-1-M和低硬度BSH为试验材料,选取果皮硬度差异最大时期即西瓜授粉30 d后的果皮,利用Illumina HiSeqTM测序平台进行转录组测序分析,采用实时荧光定量的PCR技术对测序结果进行验证.结果显示,转录组测序共筛选获得1085个差异表达基因,其中,上调表达基因555个,下调表达基因530个.GO富集分析表明,1085个差异表达基因显著富集在细胞组分、分子功能和生物过程中的细胞壁、细胞外围、外部封装结构、胞外区、四吡咯骨架、氧化还原酶活性、转移酶活性、果胶酯酶活性等功能类别.KEGG富集分析表明,Cla97C04G075800、Cla97C02G044950、Cla97C09G165820、Cla97C10G195660、Cla97C01G025380等19个差异基因被注释富集程度最高的苯丙烷代谢通路,该路径最终形成木质素、5羟基愈创木酚木质素、愈创木酚木质素和对羟基苯酚木质素代谢物,qRT-PCR和转录组测序数据相关系数R2为0.791,证明转录组试验数据可靠,从转录水平解释了(901)4-1-1-M和BSH西瓜果皮硬度存在差异的原因.

分类号： S642.9

  • 相关文献

[1]基于转录组测序的西瓜果肉硬度相关基因表达分析. 郑雪梦,时月,王雪敏,马越,赵晓燕,张超. 2020

[2]二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析. 许哲,张晨光,张思远,王先裕,高建昌. 2020

[3]不同硬度西瓜果皮发育进程中硬度变化及解剖构造研究. 张敬敬,高秀瑞,李冰,武彦荣,史宇凡,刘婧颖,潘秀清. 2021

[4]糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径. 马蕊,赵飞,范寰. 2017

[5]糙皮侧耳595发酵玉米秸秆木质素降解过程下调基因研究. 单玉雪,马蕊,郭英,郑成江,杨福,李永军,邹旸,范寰. 2017

[6]'融安金柑''滑皮金柑'及'脆蜜金柑'贮藏期品质、贮藏特性及果皮转录组分析. 刘恋,唐志鹏,李菲菲,熊江,吕壁纹,马小川,唐超兰,李泽航,周铁,盛玲,卢晓鹏. 2021

[7]黄秋葵果实质地变化的生化和转录组联合分析. 张国芹,牟建梅,陈虎根. 2023

[8]红麻过氧化物酶基因分离、过表达载体构建及转化拟南芥分析. 邓接楼,张高阳,黄思齐,李德芳. 2017

[9]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[10]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014

[11]福清山羊和戴云山羊夏季发情期卵巢组织比较转录组分析. 吴贤锋,李文杨,刘远,张莹,黄勤楼. 2019

[12]外源赤霉素诱导矮生山茶恨天高植株生长的转录组分析. 王江英,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,葛金涛,赵统利,李纪元,惠林冲,邵小斌. 2020

[13]玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,张少平,林碧珍,洪建基. 2020

[14]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020

[15]感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析. 刘玉娣,王香萍,侯茂林. 2018

[16]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019

[17]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019

[18]红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释. 吴亚维,徐娟,韩秀梅,张兴无,洪怡,文晓鹏. 2019

[19]硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析. 姚运法,练冬梅,林碧珍,赖正锋,洪建基. 2021

[20]亚麻响应低钾胁迫转录谱分析. 黄文功,姜卫东,姚玉波,宋喜霞,刘岩,陈思,赵东升,吴广文,袁红梅,任传英,孙中义,吴建忠,康庆华. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序