小麦全基因组NBS类R基因分析及2AL染色体NBS-SSR特异标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔麟轶

作者： 乔麟轶;常建忠;郭慧娟;高建刚;郑军;畅志坚

作者机构：

关键词： 小麦;抗病;NBS类基因;SSR标记;2AL染色体

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2016 年 42 卷 06 期

页码： 795-802

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NBS(nucleotide binding site)类基因是植物界中最重要的一类抗病基因。用信息学方法从普通小麦(Triticum aestivum L.)全基因组中分离出2406条含有NBS结构的完整蛋白序列,每条包含48~2272个氨基酸残基。根据NBS结构域两端是否连接CC或LRR结构域,将TaNBS分为N、CN、NL和CNL 4类。对TaNBS所在scaffold序列的SSR位点进行诊断,从1203条scaffold序列上发现2177个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占73.5%。针对小麦2AL染色体上的51个SSR位点开发标记,缺体–四体和双端体验证结果表明,有39个标记(76.5%)为2AL特异标记,其中24个特异标记在抗白粉病材料Khapli(2AL上携带Pm4a)和感病材料Chancellor间存在多态性。利用近等基因系Khapli/8*Cc筛选出3个可能与Pm4a连锁的NBS-SSR标记,分别是Sxaas_2AL22、Sxaas_2AL39和Sxaas_2AL46。本研究开发的与抗病序列紧密连锁的特异SSR标记可用于2AL染色体上抗病新基因的检测以及已有抗病基因的候选序列筛选。

分类号： S512.1

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