MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏超

作者： 代晓航;郭灵安;刘炜;赵欢

作者机构：

关键词： 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS);16SrDNA;肠杆菌科微生物;系统进化

期刊名称： 质谱学报

ISSN： 1004-2997

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 209-215

收录情况： EI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析。结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大。MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法。

分类号： O657.63`Q93

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