广西钦洲湾养殖牡蛎线粒体16SrRNA基因片段序列变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏天凤

作者： 苏天凤;江世贵;朱彩艳;周发林;陈丕茂

作者机构：

关键词： 牡蛎;线粒体DNA;16SrRNA基因;种群

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2005 年 12 卷 01 期

页码： 1-4

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR技术对广西钦洲湾水域的养殖牡蛎(传统上被认为是近江牡蛎CrassotreaariakensisFujita)群体26个个体的线粒体DNA16SrRNA基因片段序列进行扩增,获得了大约500bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定,经同源排序,得到415bp可供分析的核苷酸片段。26个个体中共检测到18个变异位点,包括1个碱基插入/缺失、11个转换位点及6个颠换位点。共有6种单倍型,这6种单倍型又分为2大类单倍型。运用MEGA软件计算出不同个体间的遗传距离,并构建了UPGMA和NJ系统树。26个个体聚成明显的2支,一支有19个个体,占73 08%;另一支有7个个体,占26 92%;2支间序列差异为3 54%。据此得出结论:钦洲湾养殖牡蛎应存在两大种群或是2个亚种,其差异是否到了种间的分界限,还需进一步研究证实。

分类号： S917

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