鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 闵霞

作者： 闵霞;贾智英;李池陶;李飞;石连玉

作者机构：

关键词： MHC;鲤鱼;多态性;多态核苷酸位点;连锁不平衡

期刊名称： 安徽农业大学学报

ISSN： 1672-352X

年卷期： 2012 年 39 卷 02 期

页码： 195-200

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据已克隆的鲤鱼MHC Ⅱ B基因序列,设计1对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对6个鲤鱼群体MHC Ⅱ B基因第3外显子108 bp扩增片段进行多态性分析,结果共获得7种基因型(A-G),其中基因型为B型的个体数占所有群体总个体数的47.45%,且分布于所有群体,其它6种基因型出现频率范围为1.1%~17.15%。回收不同基因型的片段并测序,经比对共发现4个碱基多态位点和3个氨基酸多态位点。易捕鲤和大头鲤两群体中各发现4个突变位点(占3.7%);松荷鲤、松浦鲤和德国镜鲤群体各发现3个突变位点(占2.7%);松浦镜鲤群体仅发现2个突变位点(占1.8%)。用Popgene软件计算每个群体不同位点的杂合度和多态信息含量(PIC),6个鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)最大值为0.746 4,最小值为0.103 7;多态信息含量为0.062 3~0.360 9。该研究将为今后深入研究鲤鱼MHC基因多态性及与鲤鱼抗病新品种的选育提供理论依据。

分类号： S917.4

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