草棉EST-SSRs的遗传评价

文献类型： 中文期刊

第一作者： 余渝

作者： 余渝;王志伟;冯常辉;张艳欣;林忠旭;张献龙

作者机构：

关键词： 草棉;表达序列标签;简单序列重复;多态性信息含量;遗传作图

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2008 年 34 卷 12 期

页码： 2085-2091

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR,1～6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST-SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49～0.91之间,平均为0.81。6对引物在BC1种间作图群体[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性。除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例,其余引物表现正常分离。6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱上的6条染色体:有4个位于A亚基因组的4条染色体上(Chr.6、10、11和12),2个位于D亚基因组的2条染色体(Chr.19和20)。

分类号： S562

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