小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR 分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白鹏

作者： 白鹏;程须珍;王丽侠;王素华;陈红霖

作者机构：

关键词： 小豆;SSR 标记;遗传多样性;群体结构;连锁不平衡

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 5 期

页码： 788-797

收录情况： CSCD

摘要： 利用57对小豆SSR 标记和31对绿豆SSR 标记, 用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析。结果表明, 共检测到630个等位变异, SSR 位点等位变异数在2~17之间, 遗传多样性指数范围为0.024~0.898, 平均为0.574。15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异, 其中中国云南最高, 河北和天津最低。聚类分析将254份材料划分为3个类群, 在一定程度上和地理生态环境相关。LD 分析显示和其他作物相比, 小豆LD 衰减距离较短, 最大衰减距离为5.8 cM (R~2>0.1), 基因组LD 平均衰减距离小于1 cM (R~2>0.1, P<0.001)。

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