猪戊型肝炎病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 闫蕾

作者： 闫蕾;涂亚斌;李海;张交儿;王刚;刘永刚;陈志宝;蔡雪辉

作者机构：

关键词： 猪戊型肝炎病毒;荧光定量PCR;TaqMan探针;应用

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2016 年 38 卷 04 期

页码： 322-325

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立猪戊型肝炎病毒(SHEV)的TaqMan荧光定量PCR检测方法,本研究根据SHEV基因ORF2保守区设计引物及探针,并对PCR反应条件进行优化。结果表明,该方法扩增的相关系数可达0.999,在102拷贝/μL~109拷贝/μL内具有良好的线性关系。对猪圆环病毒2型、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和伪狂犬病毒的RNA或DNA进行检测,结果均为阴性。该方法可以检出最低拷贝数为10拷贝/μL。重复性试验结果表明该方法的批内和批间变异系数均小于3.0%。本研究使用该荧光定量PCR检测方法对黑龙江省临床收集的131份样品(肝脏45份、粪便86份)进行检测,总阳性率为11.45%,其中肝脏阳性率为22.22%,粪便阳性率为5.81%。该方法的建立为SHEV的快速检出及绝对定量奠定了良好的基础。

分类号： S852.65

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