象耳豆根结线虫actin基因的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 练冬梅

作者： 练冬梅;赵志祥;陈绵才;王会芳

作者机构：

关键词： 象耳豆根结线虫;Actin基因;全长cDNA

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2014 年 27 卷 03 期

页码： 1091-1095

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR、cDNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫生长发育关键基因actin的全长cDNA序列(登录号:KF534787),并与NCBI核酸数据库进行序列比对,结果表明:序列全长1298 bp,包含一个全长1125 bp的开放阅读框ORF,编码375个氨基酸,起始密码子在82位,终止密码子在1207位,与已知的其它物种的actin具有高度的保守性,与马铃薯腐败线虫和松才线虫actin的同源性分别为99.20%和98.67%,与秀丽隐杆线虫、人类相似性分别达到98.67%和97.33%。系统发育分析表明,象耳豆根结线虫actin可能是β-actin,同时也发现了象耳豆根结线虫actin与人类的胞质actin(β-actin)更相似。本研究填补了GenBank数据库中象耳豆根结线虫内标参照基因的空白。

分类号： Q78

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