基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭燕

作者： 郭燕;乔大河;杨春;李燕;陈正武;陈娟

作者机构：

关键词： 古茶树;SNP;遗传结构;进化关系

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 26-36

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 贵州久安分布着大量的古茶树资源。为了明晰这些茶树资源间的遗传关系,本研究以分布于久安5个不同区域的100份古茶树为材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技术对它们的全基因组SNP进行了鉴定,然后基于鉴定到的SNP进行了系统进化树构建、主成分分析以及遗传结构分析。100份古茶树材料共获得548597个高质量SNP,并对这些SNP进行了变异类型注释。系统进化树、主成分分析以及遗传结构分析的结果高度一致,结果表明同一区域内的材料间亲缘关系较近;100份资源可以分为3个类群;古茶园(G)的材料与其他4个区域的材料遗传背景差异较大,这4个区域的资源可能有相同的亲本来源。

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]基于高密度SNP标记的苹果属15种植物资源的亲缘关系与遗传结构分析. 高源,王大江,王昆,丛佩华,李连文,朴继成. 2020

[2]贵州省主要栽培茶树品种指纹图谱构建与遗传结构分析. 乔大河,郭燕,杨春,李燕,陈娟,陈正武. 2019

[3]香蕉枯萎病病原菌的研究进展. 李斌,盛鸥,李春雨,魏岳荣,左存武,胡春华,易干军,罗充. 2013

[4]偶蹄家畜FMDV受体通用亚基αv基因的分子特征及其进化关系. 独军政,高闪电,常惠芸,赵建勇,丛国正,邵军军,林彤,刘湘涛,才学鹏. 2008

[5]辣椒八氢番茄红素合成酶鉴定、进化与表达分析. 郑佳秋,梅燚,吴永成,王薇薇,张丽娜,张永吉,陈以博,祖艳侠,万红建. 2022

[6]比较基因组学及其应用. 宋雪梅,李宏滨,杜立新. 2006

[7]我国绵羊无浆体16SrRNA基因序列的同源性比较. 刘志杰,殷宏,罗建勋,关贵全,马米玲,刘爱红,党志胜,高金亮,任巧云. 2004

[8]5种鲟鱼免疫球蛋白重链恒定区序列研究. 王荻,刘红柏. 2006

[9]新疆硬粒小麦5个品种5S rRNA基因重复单元间序列分析. 米日古丽·马木提,吾买尔江·库尔班,帕夏伊木·艾麦提,赵奇. 2015

[10]H9N2亚型禽流感病毒免疫原性基因的分子演化研究. 李建伟,崔尚金,于康震,贾永清,唐秀英,刘宝全,GuanY.,PeirisJ.S.M,ShortridgeK.F. 2002

[11]烟草花叶病毒属研究新进展. 侯红琴,谭志琼,张振臣. 2008

[12]蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析. 梁靖雯,王鹏,叶秀旭,盖江涛,白蓓蓓,李倩,刘咲頔,徐诗涛. 2020

[13]水貂细胞色素b基因(Cytb)克隆、序列分析及与鼬属动物的进化关系. 涂剑锋,王雷,邢秀梅,李一清,杨福合. 2010

[14]利用微卫星标记分析5个山羊品种的遗传多样性和进化关系. 李晓雨,张纪刚,狄冉,刘秋月,胡文萍,王翔宇,周忠孝,刘文忠,刘岚. 2015

[15]芝麻基因组解析与利用. 王林海. 2014

[16]珠母贝属的系统发育:核rDNA ITS序列证据. 喻达辉,朱嘉濠. 2005

[17]贵州普安县茶产业发展现状及对策. 吕军. 2013

[18]贵州久安古茶树资源的分类研究. 龚雪,杨春,郭燕,周顺珍,郑文佳. 2015

[19]古茶树优系矢车菊素分析. 成凯,刘进平,邓代信,陈正武,李忠朝,周绍均,牛素贞. 2018

[20]古茶树研究概述. 龚雪,周顺珍,陈正武,郑文佳. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序