花生PDAT基因家族的全基因组生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田海莹

作者： 田海莹;单雷;李新国;郭峰;张智猛;孟静静;万书波;彭振英

作者机构：

关键词： 花生;二酰甘油酰基转移酶;进化;表达模式;可变剪接

期刊名称： 花生学报

ISSN： 1002-4093

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 1-7+13

收录情况： 北大核心

摘要： 磷脂二酰甘油酰基转移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反应,生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的关键酶之一。为了在全基因组水平上探究花生PDAT(AhPDAT)基因家族的特征,通过生物信息学方法,结合花生基因组和转录组数据对AhPDAT家族成员从系统进化、基因结构、表达模式以及可变剪接等方面进行系统分析。结果显示,AhPDAT家族包含17个成员,不均匀分布于9条染色体上。系统进化分析发现,AhPDATs与大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,亲缘关系较近。基因结构分析显示,AhPDATs基因具有2~8个外显子,可编码88~742个氨基酸。表达模式分析发现,AhPDATs家族成员组织表达多样化,这种表达模式的差异表明它们功能分工的不同。同时,该家族基因还存在丰富的可变剪接类型。这些结果为今后进一步开展AhPDATs基因家族的功能研究提供参考,同时也为花生品质育种奠定了一定的理论基础。

分类号： S565.2

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