利用高密度遗传图谱挖掘水稻芽期耐盐QTL

文献类型： 中文期刊

第一作者： 雷蕾

作者： 雷蕾;孙世臣;曹良子;丁国华;周劲松;白良明;洛育;夏天舒

作者机构：

关键词： 高密度Bin图谱;QTL;重组自交系;耐盐;水稻;芽期

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2024 年 51 卷 009 期

页码： 18-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】挖掘水稻芽期耐盐新位点，为进一步开展基因功能分析和盐渍土直播生产提供理论依据。【方法】以耐盐品种‘龙稻133’和盐敏品种‘彩稻’衍生的169个RIL群体为试验材料，利用包含1 107个高质量多态性Bin标记的高密度遗传连锁图谱，对对照和0.5% NaCl胁迫下的胚芽鞘长、胚根数、胚根长以及相对胚芽鞘长、相对胚根数和相对胚根长共9个性状进行QTL定位分析。【结果】高密度遗传连锁图谱共覆盖水稻基因组2 957.35 cM，标记间的平均距离为2.67 cM。12条染色体含有的平均标记数为92.25个。描述性统计分析表明，亲本‘龙稻133’的耐盐性显著高于‘彩稻’，亲本的性状表型值位于RIL群体的极值之间，群体表现出超亲分离现象。盐胁迫严重抑制RIL群体的胚芽鞘长、胚根数和胚根长，且不同株系受胁迫影响差异较大，各性状基本符合正态分布，具有数量性状的遗传特性。连锁分析共鉴定到19个QTL，贡献率为2.58%～14.83%，发现2个QTL区间内存在已克隆的耐盐相关基因，其中qTCL3区间内包含DST，qRRN10区间内包含OsMSRA4.1。此外，发现控制盐胁迫下胚芽鞘长的qTCL10、控制相对胚芽鞘长的qRCL10以及控制相对胚根长的qRRL10均位于同一QTL区间内；控制盐胁迫下胚根长的qTRL7和控制相对胚根长的qRRL7也位于同一QTL区间内。2个共定位区间内的25个候选基因qRT-PCR分析结果显示，盐处理后，LOC＿Os07g44210、LOC＿Os07g44240、LOC＿Os07g44250、LOC＿Os07g44350、LOC＿Os10g42940和LOC＿Os10g43060在‘彩稻’或‘龙稻133’均显著上调表达。其中，LOC＿Os07g44350在盐处理后的‘龙稻133’胚芽鞘和胚根内均极显著上调表达。【结论】发掘19个与水稻芽期耐盐相关QTL，其中包含2个共定位位点qTRL7和qTCL10，2个共定位区间内共有25个候选基因。通过qRT-PCR分析发现6个在盐处理后表达量上调的基因，其中LOC＿Os07g44350是芽期耐盐的重要候选基因。

分类号： S511

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