鸭Toll样受体3基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋凯杰

作者： 宋凯杰;李传峰;陈宗艳;孟春春;黄云秀;李丹丹;刘光清;张淼涛

作者机构： 西北农林科技大学动物医学院;中国农业科学院上海兽医研究所

关键词： 北京鸭;TLR3;分子克隆;序列分析;结构预测

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2015 年 36 卷 07 期

页码： 22-28

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究鸭Toll样受体3(TLR3)的结构及功能,根据GenBank中已公布的番鸭TLR3(JQ910167.1)基因设计引物,采用RT-PCR从北京鸭外周血单个核细胞中克隆出北京鸭TLR3,命名为duTLR3。利用生物信息学技术预测其结构及功能,研究表明,duTLR3基因开放阅读框为2 688bp,编码895个氨基酸,富含17.0%亮氨酸;该分子属于Ⅰ型跨膜受体,由胞外区(1-695aa)、跨膜区(696-718aa)和胞内区(719-895aa)3部分组成,N端含有一个信号肽序列,胞外富含18个亮氨酸重复序列(LRR),胞内含有Toll/IL-1R同源区结构域。核苷酸序列同源性分析显示,duTLR3与金定鸭TLR3亲缘关系最接近达到99.6%;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀的亲缘关系次之,并同属于禽类分支上;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀、人、猕猴、狒狒、小鼠、大鼠、猪、牛、羊、猫亲缘关系渐远;与草鱼和鲤鱼亲缘关系最远。北京鸭体内组织分布结果显示,duTLR3为组成性表达。本研究成功克隆了北京鸭TLR3基因,预测分析并证实了duTLR3具有典型的TLR家族结构特征,为后期探究TLR3如何识别病毒的RNA及引起下游信号级联反应奠定了基础。

分类号： Q785

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