新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵立娜

作者： 赵立娜;马秀丽;李玉峰;黄兵;宋敏训;李建亮;崔言顺

作者机构：

关键词： 鸭病毒性肝炎病毒(DHV);基因组;序列分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2010 年 30 卷 02 期

页码： 202-205

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)分离株JFX08的全基因组进行了序列测定与分析。结果表明,JFX08毒株的基因组全长为7793nt,包括652nt的5’UTR,6753nt的ORF,366nt的3’UTR以及19nt的poly(A)尾巴。JFX08毒株的ORF编码2251个氨基酸,各基因均与韩国新型毒株的氨基酸序列相似性最高,与1型DHV和台湾新型DHV的序列相似性均较低。其中VP1较1型DHV存在2个氨基酸的插入和较多氨基酸位点的突变,高变区主要集中在180～194位和213～219位。JFX08毒株的非编码区核苷酸序列之间存在大量碱基突变和插入/缺失。多聚蛋白、VP0、VP3、VP1、2C和3D基因进化分析结果均表明,JFX08分离株与韩国新型DHV的遗传距离最近,属基因C型。

分类号： S858.32

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