不同植物DNA条形码对铁皮石斛鉴定能力的评价
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈文强
作者: 陈文强;汪小福;陈笑芸;彭城;徐俊锋;蔡健
作者机构:
关键词: 铁皮石斛;DNA条形码;分子鉴定;遗传距离
期刊名称: 食品科学
ISSN: 1002-6630
年卷期: 2021 年 022 期
页码: 131-139
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为选择适合准确鉴定铁皮石斛的DNA条形码,以25份铁皮石斛样品和10份其他不同种类石斛为实验材料,利用目前常用的9条植物DNA条形码(ITS2、nad1、matK、ycbL、psbK-psbI、trnL-trnF、trnG-trnS、rbcL和trnH-psbA)对这些石斛材料进行分子鉴定。结果显示,9条DNA条形码的扩增率和测序成功率均很高,通用性很强。其中,rbcL与trnH-psbA的种内最大遗传距离大于种间最小遗传距离,不符合条形码的基本要求,其余条形码遗传距离均符合种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离的要求。种间变异顺序为ITS2>trnL-trnF>trnG-trnS>psbK-psbI>ycf1b>matK>nad1,其中ITS2的进化速率最快,变异率最高(25.1%)。ITS2和trnL-trnF对本实验中石斛材料的分辨率达到90.1%,建议ITS2+trnL-trnF作为铁皮石斛种质资源鉴定的DNA条形码。本研究为利用DNA条形码技术鉴别铁皮石斛及其近源种石斛提供了参考和分子依据。
分类号: R282.5
- 相关文献
[1]DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用. 万方浩,张爱兵,闵亮,张桂芬. 2012
[2]基于ITS2和SNP技术鉴定浙江铁皮石斛的初步研究. 陈文强,汪小福,陈笑芸,彭城,徐俊锋,蔡健. 2021
[3]基于DNA条形码技术对镰刀菌属的检测鉴定. 雷娅红,况卫刚,郑春生,李秀璋,高文娜,李春杰. 2016
[4]南极鱼亚目鱼类DNA条形码及分子系统学. 姜郦轩,张吉昌,樊钢洲,李昂,柳淑芳,庄志猛. 2021
[5]基于线粒体COI基因的3种草蛉的系统发育关系分析. 胡红岩,张职显,卢珍华,任相亮,马小艳,马亚杰,宋贤鹏,马艳. 2021
[6]DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用. 李献儒,柳淑芳,李达,杜腾飞,庄志猛. 2015
[7]DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性. 王开杰,徐永江,柳学周,崔爱君,姜燕,王滨,方璐. 2022
[8]基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定. 田虎,张金良,张桂芬,陈苗苗,万方浩. 2014
[9]筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品. 梅瑜,邱道寿,肖深根,彭淼,陈栋. 2019
[10]基于trnL-trnF基因序列鉴定10种枸杞属种质资源. 万如,王亚军,赵建华,马婷慧,石志刚. 2020
[11]思南茶园茶尺蠖的分子鉴定. 孟泽洪,李帅,赵兴丽,杨文,周玉锋. 2019
[12]稗属植物DNA条形码研究. 袁国徽,田志慧,李涛,钱振官,沈国辉. 2021
[13]基于psbA-trnH序列条形码鉴定21份枸杞属植物. 万如,王亚军,安巍,李彦龙,秦垦,赵建华,马婷慧,石志刚. 2019
[14]DNA条形码技术在黑龙江地区姬小蜂科物种鉴定中的应用与分析. 邵天玉,刘思竹,谢维欣,刘兴龙,李志勇,王克勤,朱朝东,刘丹. 2023
[15]蓟马的分子鉴定和种群遗传学研究进展. 何嘉,刘新芝,杜振勇,刘巧巧,李虎,杨海林,彩万志. 2023
[16]我国新入侵外来害虫美洲棘蓟马的外部形态和分子鉴定. 魏书军,马吉德,石宝才,宫亚军,刘静,康总江,陈学新,路虹. 2010
[17]中药材白及分子鉴定研究进展. 金亮,郭方其,付曼曼,吴超,李小白. 2024
[18]铁皮石斛促生内生真菌的筛选与鉴定. 吴慧凤,宋希强,胡美姣. 2011
[19]入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马的分子鉴定. 游中华,路虹,张宪省,冯纪年,石宝才,宫亚军,黄大卫. 2007
[20]动物DNA条形码鉴定技术及其在害虫种类鉴定中的应用. 张莉,苏生,吕召云,孟泽洪. 2014
作者其他论文 更多>>
-
昆虫抗白僵菌免疫应答及其在害虫防治中的应用潜力
作者:杨蕾;汪小福;魏巍;陈笑芸;彭城;徐晓丽;徐俊锋
关键词:虫生真菌;表皮免疫;免疫通路;抗真菌免疫应答;害虫防治
-
Bt和Bar基因转化对水稻不同组织生态位微生物群落组成及潜在功能影响
作者:葛蕾;王璐瑶;郭官清;宋丽莉;王翠;汪小福;毛婵娟;李鹏
关键词:内生菌;生态位;根际微生物;Bt基因;微生物群落网络
-
羊源性基因组DNA标准物质研制
作者:纪艺;王凯莉;余卉茹;赵新;丁霖;彭城;徐俊锋;陈笑芸
关键词:标准物质;羊源性HELZ基因;数字PCR
-
基于免扩增高通量测序的转基因定量检测方法研究
作者:李凯;付军;陈锐;陈笑芸;李亮
关键词:质粒DNA;标准物质;测序技术;dPCR
-
温度对稻米品质影响的研究
作者:蒙秀菲;伍祥;曾涛;张上都;彭菊;金明;叶勇;周乐良;熊玉堂;陈文强;张元虎
关键词:温度;优质水稻品种;稻米品质
-
不同生育期氮肥施用量对稻米品质的影响
作者:蒙秀菲;伍祥;金明;张上都;彭菊;曾涛;周乐良;陈文强;熊玉堂;张元虎
关键词:分蘖肥;优质水稻品种;稻米品质
-
西瓜细菌性果斑病菌现场快速双模荧光RPA检测方法的建立
作者:王晨薇;汪小福;魏巍;陈笑芸;沈洁;徐俊锋;蔡健
关键词:瓜类细菌性果斑病;实时荧光监测RPA;终端荧光可视化检测RPA;可视化