柑橘NHX基因的鉴定及盐胁迫下表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 岳杨

作者： 岳杨;张德健;王鹏;金龙飞

作者机构： 长江大学园艺园林学院;浙江省柑橘研究所

关键词： 柑橘;NHX;生物信息学;基因表达

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2025 年 53 卷 004 期

页码： 161-168

收录情况： 北大核心

摘要： 为研究柑橘NHX基因家族的生物学特性，利用生物信息学方法从枳全基因组数据库筛选出8个NHX基因，并对其基因结构、亚细胞定位、保守序列、启动子顺势作用元件、共线性、进化关系以及在枳和酸橙中的表达特征进行分析。结果表明，8个PtNHXs基因分布在6条染色体上，进化关系上可以分为3个亚族，编码的蛋白质氨基酸数为250～1 128 aa,分子量为27.64～125.20 ku,等电点为5.11～9.36,亲水系数为0.022～0.797,均为疏水性蛋白。亚细胞定位预测表明，PtNHX2和PtNHX8位于细胞膜，其余6个成员均位于液泡。8个PtNHX外显子数量为8～24个，含有的motif数量介于5～9个之间，均含有motif3,启动子顺势作用元件分析发现NHX的启动子中含有大量光、逆境胁迫和激素响应的元件。共线性分析结果显示，枳的物种内有2对共线性关系，枳与拟南芥之间有8对共线性关系。qRT-PCR结果发现，NHX1、NHX5、NHX7在枳中的表达量受盐胁迫诱导，可作为后续柑橘耐盐研究的候选基因。NHX2和NHX8在酸橙中的表达量显著高于枳，这可能是酸橙比枳耐盐的原因之一。结果可为进一步探索柑橘NHX基因的潜在机制及盐胁迫下候选基因的挖掘提供了理论基础。

分类号： S666

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