基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 潘婷

作者： 潘婷;张岩;张辉;高天翔;肖永双;姜云荣

作者机构：

关键词： Roche 454 GS FLX;钝吻黄盖鲽;开发;微卫星标记

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2015 年 36 卷 01 期

页码： 26-32

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Roche 454 GS FLX平台测序技术进行了钝吻黄盖鲽微卫星引物筛选,并采用聚类分析的方法对得到的5641个微卫星位点进行类比分析,得到247种多态性位点,其中完美型占52.22%,非完美型占20.24%,复合型占27.54%,(AC)n、(AG)n两碱基重复类型的比例是44%,重复次数在10次以上的占总数的87.5%。随机选取11个位点的微卫星引物,采用5个野生个体,利用荧光标记和毛细管电泳进行多样性评价,4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,不同位点得到的等位基因范围为3-8,平均等位基因数为5.0。平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)及平均多态性信息含量(PIC)分别为0.588、0.788和0.670。结果表明,454 GS FLX提供了一种直观、高效开发微卫星的方法。

分类号： S917.4

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