珠母贝属6个种的ITS 2分子标记研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 喻达辉

作者： 喻达辉;朱嘉濠

作者机构：

关键词： 种类鉴定;基因型;序列变异;核糖体DNA

期刊名称： 南方水产

ISSN：

年卷期： 2005 年 1 卷 04 期

页码： 10-16

摘要： 对珠母贝属的大珠母贝、珠母贝、白珠母贝、黑珠母贝、长耳珠母贝、黑珠母贝和合浦珠母贝6个种的内部转录间隔区2(ITS2)序列及其两侧的5.8S和28S的部分序列进行了比较分析。其中黑珠母贝的序列来自GenBank。PCR扩增片段大小为600bp左右,测序结果表明,ITS2长211～254bp,两端的5.8S和28S分别长84bp和272bp(均含引物)。序列比对分析结果表明,5.8S和28S序列高度保守,不适合于种类鉴定,而ITS2序列高度变异,270个比对位点中有146个位点发生突变,其中72个位点发生插入/缺失突变。除白珠母贝和黑珠母贝之间的遗传距离较小外,其余种类之间的遗传距离远远大于种内遗传距离。基因型分析表明,每个种具有各自特有的基因型。基因型和序列变异分析表明ITS2序列可作为珍珠贝种类鉴定的分子标记。可用于种间、杂交育种、幼体和珍珠贝肉等材料的种类鉴定与遗传分析。

分类号： Q953

  • 相关文献

[1]细胞核rDNA序列用于罗非鱼及其杂交种鉴别的初步研究. 郭奕惠,喻达辉. 2009

[2]粳稻超亲变异系籽粒谷氨酰胺合成酶基因表达特性及序列变异分析. 徐振华,曲莹,刘海英,朱立楠,张忠臣,金正勋. 2016

[3]重庆南瓜病毒病病原ELISA检测及CMV变异分析. 青玲,包凌云,周常勇,杨水英,孙现超. 2010

[4]MIC5基因在13株不同基因型的刚地弓形虫中的序列变异（英文）. 刘文阁,徐晓佩,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015

[5]中国葡萄类病毒基因多样性分析及其新种的发现. 姜冬梅,郭瑞,彭山,吴祖建. 2009

[6]葡萄A病毒辽宁分离物外壳蛋白基因克隆及序列变异分析. 任芳,范旭东,董雅凤,张尊平,王教敏. 2012

[7]罗非鱼选育群体Cytb与D-loop序列变异信息对比分析. 颉晓勇,李思发. 2014

[8]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2008

[9]大豆盐胁迫相关GmNAC基因的鉴定、表达及变异分析. 张彦威,张礼凤,李伟,王彩洁,张军,徐冉. 2016

[10]秀丽白虾3个地理种群mtDNA 16S rRNA基因序列变异及遗传分化. 张敏莹,徐东坡,方弟安,周彦锋,刘凯. 2018

[11]GRA24基因在不同地理位置和宿主来源的刚地弓形虫株间的序列变异（英文）. 徐晓佩,刘文阁,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015

[12]细胞核rDNA序列分析5种罗非鱼的亲缘关系. 郭奕惠,喻达辉,黄桂菊,符云,叶卫. 2009

[13]细胞质雄性不育高粱叶绿体ndh D基因的序列变异(英文). 范昌发,孙春昀,郭骁才,张福耀,孙毅,牛天堂,贾敬芬. 2002

[14]桃树啤酒花矮化类病毒(HopStuntViroid;HSVd)的鉴定及序列变异分析. 李世访,成卓敏,赵剑波,姜全. 2006

[15]基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构. 孙鹏,尹飞,施兆鸿,彭士明. 2012

[16]一种降低dATP用量的简单易错PCR方法. 高义平,赵和,吕孟雨,孙果忠,杨学举,王海波. 2014

[17]水稻孤雌生殖诱导基因BBM1序列变异分析. 汪晴,王艳茹,张秀丽,吕启明. 2024

[18]环介导恒温扩增技术快速检测米氏凯伦藻方法的建立. 张凤英,徐兆礼,马凌波,郑俊斌,缪宇平,陆亚男. 2009

[19]瘿蚊科3种昆虫核糖体DNA的克隆及序列分析. 段云,郭培,巩中军,苗进,李彤,蒋月丽,武予清. 2020

[20]几种帘形目贝类RDNA ITS序列的比较. 刘相全,包振民,胡景杰,王师,方建光,王如才. 2007

作者其他论文 更多>>

微信小程序