葡萄实时荧光定量PCR稳定内参基因的筛选和验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任芳

作者： 任芳;张尊平;范旭东;胡国君;李晨;董雅凤

作者机构：

关键词： 葡萄;内参基因;实时荧光定量;PCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 23 期

页码： 7801-7810

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选择稳定的内参基因是实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qPCR)分析的重要条件。本研究采用不同品种、季节和组织部位葡萄样品为研究材料,利用qPCR测定了19个候选内参基因相对表达量,并采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等3个软件对候选内参基因表达稳定性进行分析评价。3个软件分析结果表明,表达最稳定的3个内参基因均为GAPDH、UBQ-1和EF1α-1。为验证内参基因稳定性,以筛选出的GAPDH、UBQ-1和EF1α-1为内参,对感染葡萄病毒E (Grapevine virus E, GVE)的不同部位葡萄样品中GVE相对表达量进行qPCR分析。结果表明,GAPDH、UBQ-1和EF1α-1分别单独作内参和3个基因组合作为内参进行相对定量时,GVE在植株不同部位样品中的相对表达量变化趋势基本一致,表明这3个内参基因在葡萄不同组织部位中稳定表达,适合作为葡萄qPCR分析的内参基因。

分类号： S663.1

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