水稻LEA基因家族的全基因组鉴定及综合分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵贺

作者： 赵贺;冀亚亮;梁潇;阮班普;于彦春;马殿荣

作者机构：

关键词： 水稻;LEA基因家族;非生物胁迫;启动子顺式作用元件;组织表达模式

期刊名称： 沈阳农业大学学报

ISSN： 1000-1700

年卷期： 2025 年 56 卷 005 期

页码： 14-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]大量研究表明,LEA蛋白能够通过多种机制帮助植物应对环境压力,在水稻中仍有大量LEA家族成员的功能尚未得到充分验证.因此,通过对水稻LEA基因家族(OsLEA)的生物信息学分析,并结合其在不同胁迫下的基因表达变化,旨在挖掘参与水稻中响应非生物胁迫的OsLEA新成员.[方法]采用全基因组生物信息学方法对OsLEA基因家族进行了鉴定和分析.[结果]水稻基因组中共包含83个OsLEA基因家族成员,这些基因不均匀地分布在12条染色体上,根据其结构域特征可分为8个亚家族.理化性质分析显示,LEA蛋白具有广泛的亲水性和较强的稳定性.亚细胞定位预测表明,大多数LEA蛋白分布在细胞质、细胞膜和线粒体等细胞组分中.启动子顺式作用元件分析表明,OsLEA基因的启动子区域富含与非生物胁迫、植物激素响应和生长发育相关的元件.组织表达模式和激素响应分析揭示,OsLEA基因在不同组织和不同植物激素处理中表现出显著的表达特异性.此外,非生物胁迫(低温、高温、盐和重金属镉)处理下,部分OsLEA基因表现出明显的应答.[结论]通过整合生物信息学分析及多种激素与逆境胁迫下的表达谱数据,初步揭示了OsLEA基因家族参与逆境响应的分子调控机制.基于此,成功筛选出Os04g0589800、Os05g0362600、Os06g0324400和Os08g0163600等核心成员基因,其在高盐、高温及低温胁迫下均呈现显著表达上调特征,证实了它们在非生物胁迫应答中的关键生物学功能,为抗逆水稻育种提供了极具应用潜力的分子靶标.

分类号： S511

  • 相关文献

[1]水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析. 马银花,刘桃梅,万天雪,肖新波,胡琼,李萍芳,段仁燕,张斌,金晨钟,杜波. 2023

[2]蒺藜苜蓿LEA基因家族全基因组分析. 刘志敏,刘文献,贾喜涛,张正社,王彦荣. 2015

[3]蓖麻LEA基因家族的全基因组鉴定、分类及其进化分析. 邹智,黄启星,安锋. 2013

[4]栽培种花生LEA蛋白基因家族的鉴定及其低温胁迫下表达分析. 付娆,李佳佳,单燕,张海洋,衣葵花,修妤,梁晓艳,张佳蕾. 2022

[5]中华蜜蜂感觉神经元膜蛋白基因克隆、组织表达分析及原核表达. 胡颖颖,徐书法,李薇,Abebe Jenberie WUBIE,国占宝,周婷. 2013

[6]企鹅珍珠贝组织蛋白酶D的cDNA克隆、序列特征分析和应激表达研究. 潘俐玲,黄桂菊,成书营,王晓宁,喻达辉. 2012

[7]黄瓜WIP转录因子家族基因的鉴定及表达分析. 韩瑞月,刘晓林,辛同旭,李森,杨学勇,孙进京. 2025

[8]甘薯IbNRT2基因家族全基因组鉴定和表达分析. 王 芳,乔 帅,宋 伟,崔 鹏娟,廖 安忠,谭 文芳,杨 松涛. 2025

[9]甘薯IbNRT2基因家族全基因组鉴定和表达分析. 王芳,乔帅,宋伟,崔鹏娟,廖安忠,谭文芳,杨松涛. 2025

[10]水稻转录因子Os1137的克隆及其耐盐性分析. 邢国杰,马建,高明,谭化,刘艳芝. 2014

[11]水稻Bph14基因生理功能初探. 李三和,闸雯俊,陈志军,周雷,刘凯,游艾青. 2017

[12]水稻耐低温研究重要进展. 刘静妍,闫双勇,张融雪,苏京平,孙玥,孙林静. 2020

[13]水稻锌指蛋白基因OsBBX6的克隆、表达及生物信息学分析. 张超,黎妮. 2019

[14]水稻AP2/EREBP转录因子响应非生物胁迫的表达谱分析. 靳鹏,黄立钰,王迪,吴慧敏,朱苓华,傅彬英. 2009

[15]水稻锌指蛋白基因OsBBX13的克隆、表达及生物信息学分析. 张超,王伟平. 2019

[16]稻米品质调控的分子基础及非生物胁迫对稻米品质的影响. 牛淑琳,唐苗苗,杜晨阳,王增兰,谢先芝,郑崇珂. 2022

[17]水稻OsSHAT1和OsRSR1应答激素及逆境胁迫的表达特性. 李哲,张少绚,黄荣峰. 2015

[18]核黄素参与水稻非生物胁迫的响应分析. 夏清珊,周正琨,谭炎宁,刘选明,秦迪岚,林建中. 2023

[19]非生物胁迫对水稻抽穗期的影响. 孟祥雪,彭永彬,郑崇珂,谢先芝,和亚男. 2023

[20]一个水稻串联锌指蛋白OsDOS基因的表达模式分析. 张程,郑君,钱凤芹,马汇泉,谢先芝. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序