基于线粒体序列的新疆4个河鲈野生群体的遗传现状分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 徐璞

作者: 徐璞;鲁翠云;孙志鹏;霍堂斌;金洪宇;吴学工;郑先虎

作者机构:

关键词: 河鲈;新疆;线粒体;遗传结构

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2022 年 29 卷 007 期

页码: 980-993

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解我国新疆地区河鲈(Perca fluviatilis)的遗传现状,本研究分析了新疆乌伦古河水系和喀啦额尔齐斯河4个河鲈野生群体的线粒体CO Ⅰ、Cytb和D-loop3个区段序列的遗传多样性,并与欧洲群体进行了比较.结果显示,新疆4个群体的线粒体CO Ⅰ、Cytb基因和D-loop区序列分别有3、10和10个变异位点(分别占序列总长的0.49%,0.90%和 1.92%),定义了 4、11 和 11 个单倍型,单倍型多样性分别为 0.065±0.022、0.276±0.049 和 0.186±0.046,核苷酸多样性分别为0.00011±0.00004、0.00033±0.00007和0.00084±0.00013,呈现出低水平遗传多样性.中国新疆河鲈群体和欧洲群体不存在共享的单倍型,单倍型聚类树和网络图也表现出明显分隔,两者为不同的遗传系谱.中国新疆乌伦古河水系的乌伦古湖(WL)、吉力湖(JH)和乌伦古河(WR)3个群体基于Cyt b基因和D-loop区序列估计群体间变异分别为-0.005%和0.44%,遗传分化系数(Fst)为-0.00045和0.00436,处于低程度分化(Fst<0.05),两两群体间的遗传分化程度较低(Fst=-0.01158~0.01803),遗传交流多,为同一个遗传系谱,尤其是两湖之间存在共享单倍型,Fst均为负值,基因交流频繁,无遗传分化;喀啦额尔齐斯河(ER)与乌伦古河水系共4个群体基于CO Ⅰ基因估计群体间变异为1.57%,Fst为0.01568,但ER群体与WL群体处于中度遗传分化(Fst=0.06614>0.05),ER与WR群体处于高度遗传分化(Fst=0.24627>0.15),可能由于水坝的阻断,遗传资源得不到补充,喀啦额尔齐斯河形成了一个独立的遗传系谱.本研究结果可为新疆河鲈种群多样性保护以及种质资源开发利用提供参考.

分类号: S931

  • 相关文献

[1]新疆乌伦古湖河鲈食性变化的研究. 唐富江,姜作发,阿达可白克·可尔江,蔡林钢,吴青. 2008

[2]新疆乌伦古湖河鲈二十年来种群生长变化及原因. 唐富江,姜作发,阿达可白克·可尔江,霍堂斌,蔡林钢. 2009

[3]连环湖河鲈的生长特性及资源评估. 赵晨,丛艳锋,王乐,宋聃,都雪,张澜澜,孙佳伟,王慧博,黄晓丽,霍堂斌. 2022

[4]不同贮藏温度对河鲈新鲜度与质构性能的影响. 张强,胡维岗,金新文. 2015

[5]水丰水库入侵鱼类河鲈的年龄结构与生长特性. 徐浩然,王兴兵,李赫,郭冰. 2021

[6]八种植物线粒体基因组结构特征分析与比较. 李玉秋,赵洪锟,谭化,刘晓东,张春宝,董英山. 2011

[7]植物CMS线粒体相关开放阅读框(ORFs)研究进展. 周瑞阳,陈鹏,廖剑. 2011

[8]正丁醇和高光强下转玉米pepc基因水稻叶片超微结构的变化. 李霞,王超,任承刚,丛伟,金磊,郭士伟. 2010

[9]柞蚕线粒体Cyt b基因片段的序列多态性分析. 孙玲,王凤成,王秋实,刘彦群,仝振祥,冀万杰,张博,王学英. 2008

[10]基于线粒体COI和16S rRNA基因研究3个地理群体黑龙江河蓝蛤的遗传多样性. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2015

[11]梭梭属2种植物线粒体基因组的提取. 吴明朝,张明慧,杨丽丽,石磊,陈虞超,宋玉霞. 2013

[12]泡状带绦虫线粒体部分基因克隆及序列比对分析. 项海涛,尚清炎,郝宝成,邢小勇,梁剑平,胡永浩. 2012

[13]植物Prohibitins基因(PHBs)的研究进展. 夏梦,徐畅,王吉,王玲,孙丹. 2016

[14]采用基于PCR的分子标记区分胡萝卜育性. 付任胜,管长志,尹立荣,陈磊,段红英,刘俊环. 2015

[15]野生亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源研究. 户国,王芳,周建设,潘瑛子,李宝海,谷伟,孙鹏,白庆利,王炳谦. 2016

[16]家蚕、野桑蚕线粒体Cyt b基因片段序列分析及分子进化研究. 李爱玲,徐安英,沈兴家,唐顺明,张志芳,潘沈元. 2004

[17]光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性研究. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2013

[18]鱼油或共轭亚油酸对小鼠卵母细胞体外发育能力和线粒体功能的影响. 易丹,曾申明,呙于明. 2012

[19]竹节人参对小鼠乙醇性胃黏膜损伤的保护作用. 李有贵,徐刚,陈诗,钟石,计东风. 2007

[20]芹菜线粒体atp6基因的克隆及在花发育过程中的表达. 谭国飞,钟秀来,罗庆,王天文. 2019

作者其他论文 更多>>