猪δ冠状病毒重庆流行株的诊断与N基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴学婧

作者： 吴学婧;于吉锋;叶勇刚;肖璐;毛从剑;曹冶;康润敏

作者机构：

关键词： 猪δ冠状病毒;诊断;N基因;遗传进化分析

期刊名称： 畜禽业

ISSN： 1008-0414

年卷期： 2024 年 35 卷 002 期

页码： 1-8

摘要： 2023 年重庆市某规模化养猪场猪群发生腹泻疫情,通过临床观察、RT-PCR检测、N基因克隆测序及序列分析对采集的腹泻仔猪肠道组织进行鉴定.结果显示,发病猪水样腹泻,小肠壁变薄、黏膜充血;成功检测到1 株猪δ冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV),命名为CQ2023 株.该毒株N基因序列全长1 029 bp,与30 株GenBank中登录的参考毒株N基因序列比对显示,核苷酸序列相似性为96.7%~99.4%,其中PDCoV CQ2023 株与CHN-HeN06-2022 株的相似性最高,为99.4%.遗传进化分析显示PDCoV CQ2023 株属于国内流行株,与国内PDCoV毒株CHN-HeN06-2022 等处于同一进化分支,亲缘关系最近.该次研究成功鉴定出该猪场腹泻疫情由PDCoV感染引起,并进行了N基因序列分析,为PDCoV的流行病学研究、遗传进化、预防及诊断试剂的研究提供数据支持.

分类号： S852.651

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