6个不同品种荔枝果肉内生细菌群落多样性的高通量测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史发超

作者： 史发超;蔡长河;严倩;姜永华;刘海伦;文英杰;欧良喜;陈洁珍

作者机构：

关键词： 荔枝果肉;内生细菌;群落结构;微生物多样性;优势菌群;高通量测序

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2024 年 51 卷 002 期

页码： 29-38

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]内生菌在植物生长发育中发挥重要作用,分析不同品种荔枝果肉内生细菌群落结构及多样性,挖掘和利用潜在荔枝内生菌种资源,为进一步研究荔枝与内生菌互作关系提供参考依据.[方法]以 6 个不同品种荔枝的果肉组织为材料,PCR扩增16S rDNA的V3~V4区,利用MiSeq高通量测序技术分析果肉组织内生细菌在门、科、属和种分类水平上的群落组成及优势菌群,结合Alpha多样性分析评估内生细菌群落多样性.[结果]对 6 个品种荔枝果肉内生细菌 16S rDNA的V3~V4 区进行扩增,共获得 2 139 086 条序列,其平均长度为 376 bp.不同品种荔枝果肉内生细菌群落在相对丰度和多样性上无显著差异.在门分类水平,变形菌门为主要优势细菌门类,其次为放线菌门.在科、属和种分类水平上,不同品种荔枝内生菌群落结构相似,但相对丰度占比不同.差异菌群分析结果显示,假单胞菌属(Pseudomonas)、果胶杆菌属(Pectobacterium)、苍白杆菌属(Ochrobactrum)和迪基氏菌属(Dickeya)在优良品种'鹅蛋荔''糯米糍'和'观音绿'中显著富集,根瘤菌属(Bradyrhizobium)和变形菌属(Snodgrassella)只在'鹅蛋荔'中富集.根据菌群相对丰度进行聚类分析,'观音绿''糯米糍'和'鹅蛋荔'的相似性更高.Alpha多样性分析结果表明,6 种荔枝果肉内生菌群仅在丰度和多样性上存在差异,但未达到显著水平.[结论]该研究首次分析了 6 个不同品种荔枝果肉内生细菌的群落结构,并在优良荔枝品种中发现特有的微生物类群富集现象,可为后续提升荔枝品质、开发利用内生菌提供理论依据和重要参考.

分类号： S667.1%TS201.3

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