10种海参16SrDNA序列多样性及其亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 费来华

作者： 费来华;李赟;陈家鑫

作者机构：

关键词： 海参;16SrDNA;系统发生

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2008 年 15 卷 05 期

页码： 755-765

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序。获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离。结果发现,10种海参富含AT碱基,A+T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007~0.316之间。所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP*4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系。结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近。对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于刺参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Holothuria edulis)关系最近。这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]几种帘形目贝类RDNA ITS序列的比较. 刘相全,包振民,胡景杰,王师,方建光,王如才. 2007

[2]中国达氏鳇野生群体和两个养殖群体的线粒体遗传多样性分析. 户国,程磊,马波,孙大江,王斌,刘晓勇,柳淑芳,张颖. 2018

[3]牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用. 王顺利,薛璟祺,任秀霞,李丹丹,杨若雯,曾秀丽,张秀新. 2016

[4]植物蔗糖转运蛋白研究进展. 齐素坤,侯夫云,秦桢,李爱贤,王庆美,张立明. 2016

[5]云南蔗区甘蔗线条花叶病毒分离物NIa基因形成新簇. 李文凤,李世访. 2016

[6]4个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析. 罗惠娣,毛杨毅,周胜花,郭慧慧,李春艳,张丽,李希,李俊,王志武,张冠武,王栋才. 2010

[7]中国绒山羊遗传多样性现状和系统发生关系的微卫星分析. 狄冉,何晓红,韩建林,关伟军,浦亚斌,赵倩君,傅宝玲,马月辉. 2007

[8]中国四个地方驴品种mtDNA D-Loop部分序列分析与系统进化研究. 孙伟丽,杨博辉,曹学亮,孙永峰,梁春年,刘建斌. 2007

[9]鲮β-肌动蛋白基因的分子克隆及其作为分子内标的可靠性分析. 张殿昌,江世贵,邵艳卿,黄燕琴. 2006

[10]草菇的系统分类地位及分化时间. 龚明,鲍大鹏,汪虹,谭琦,陈明杰. 2013

[11]宁夏地方绵羊品种mtDNAD-loop环序列遗传多样性与起源研究. 马丽娜,马青,马小明,杨炜迪,李颖康. 2014

[12]东海常见鲳属鱼类的形态差异及系统进化关系探讨. 赵峰,马春艳,庄平,章龙珍,施兆鸿. 2011

[13]中国4个绒山羊品种微卫星DNA遗传多样性和亲缘关系的初步分析. 狄冉,何晓红,关伟军,浦亚斌,赵倩君,马月辉. 2008

[14]家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析. 柴春利,代方银,潘敏慧,杜周和,胡海,鲁成. 2010

[15]山东省地方绵羊品种间表型与遗传关系分析. 苑存忠,马月辉,王建民,尚友国,张宁波,李建平. 2006

[16]4个地方绵羊品种系统发生关系的微卫星分析. 毛杨毅,罗惠娣,仪治本,张喜忠,贺东昌,梁全忠,任克良,张李俊. 2010

[17]基于16SrRNA序列探讨龟鳖类的遗传分化和系统发生. 郑将臣,万全,程起群,赵金良. 2011

[18]利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性. 张爱玲,马月辉,李宏滨,关伟军,浦亚斌,张英汉,陈宏,赵倩君,何晓红. 2006

[19]大麦黄条点花叶病毒的分布及其分离物的遗传多样性. 杨菲,张爱红,孟凡思,霍良占,李希望,邸垫平,苗洪芹. 2018

[20]胶质类芽孢杆菌功能及基因组学研究进展. 马鸣超,姜昕,李力,李俊. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序