SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜晓云

作者： 杜晓云;张青林;黄建民;罗正荣

作者机构：

关键词： 柿属植物;种质鉴定;亲缘关系;逆转座子;特异序列扩增多态性(SSAP)

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2010 年 18 卷 04 期

页码： 66-72

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对SSAP(特异序列扩增多态性;sequence-specific amplification polymorphism)在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究,并对每个SSAP引物单独用于柿属植物遗传分析的性能作了探讨。基于5个逆转座子引物的25对SSAP引物组合在供试28份柿属(Diospyros L.)基因型中共扩增出1300个位点(多态位点93.38%),每对引物平均产生52个位点(含48个多态位点),表明SSAP是一种高多重比例系数(multiplex ratio)和高多态性的标记系统;经SSAP数据的UPGMA聚类和主坐标分析,原产中国、日本的柿种质(D.kakiThunb.)及柿的近缘种各自单独成组,该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材十分吻合,表明SSAP技术可用于柿属植物亲缘关系研究。此外,在25对SSAP引物组合中筛选出3对具高信息含量的引物组合,将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用。

分类号： S665.2

  • 相关文献

[1]利用IRAP技术揭示部分柿属种间遗传关系. 杜晓云,宿福园,张青林,王彦波,曾明,罗正荣. 2012

[2]浙江部分柿属植物鉴定及亲缘关系的SSR分析. 陈方永,倪海枝,何理坤,王引,卢国耀. 2011

[3]微卫星标记在鲟鱼分子遗传学研究中的应用. 刘伟,孔杰,王霞. 2017

[4]分子标记在鱼类中的应用研究进展. 孔杰,王金乐,关梅,杨兴. 2012

[5]基于火龙果转录组测序的SSR标记开发及种质亲缘关系分析. 杨仕美,乔光,毛永亚,杨鹍,文晓鹏. 2018

[6]中国板栗种质资源的AFLP分析. 兰彦平,周连第,姚研武,王尚德,刘国彬. 2010

[7]部分湖北海棠种质的鉴定及亲缘关系分析. 张靖国,胡红菊,徐育海,罗正荣. 2009

[8]基于i PBS和ISSR分子标记的兜兰属同色组种质鉴定及遗传多样性分析. 廖宏英,范继征,李秀玲,崔学强,王晓国,宁云芬. 2023

[9]部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选. 罗纯,吴迪,张青林,罗正荣. 2014

[10]柿属植物超低温保存技术研究进展. 林积秀,郭祥桃,张艳芳,黄镜浩,温寿星. 2017

[11]柿属植物分子标记和基因工程技术研究进展. 陶磅,冷平,李天红,齐建勋. 2006

[12]内切酶接头引物对柿属SSAP分子标记扩增的影响. 杜晓云,黄建民,张青林,罗正荣. 2010

[13]逆转录转座子LINE-1的活性调控及其在癌症中的作用. 李一向,成春燕,胡文进,周礼芹. 2018

[14]苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建. 周军永,孙其宝,孙俊,王昆. 2010

[15]东乡野生稻基因渐渗系中逆转座子逆转录酶序列的克隆及表达分析. 陈雅玲,罗向东,张帆涛,戴亮芳,胡标林,谢建坤. 2013

[16]基于棉花逆转座子的SSAP标记的开发. 曹志斌,杨郁文,徐鹏,张香桂,张保龙,倪万潮,沈新莲. 2009

[17]水稻逆转座子的研究现状. 马秀芳,高勇,华泽田,吕桂兰,李娜,王大为,丁芬. 2003

[18]苹果IRAP技术体系的建立及优化. 贾怀志,刘艳红,渠慎春,高志红,王昆,章镇. 2009

[19]植物逆转座子引物开发应用中的逆转座子序列分离方法. 杜晓云,张青林,黄建民,罗正荣. 2010

[20]苹果中Ty1-copia型逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析. 孙俊,房经贵,高兵,章镇,孙其宝. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序