Btcry序列本地数据库的建立及本地BLAST的实现

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘旭光

作者： 宋福平;张广杰;张新会;张杰

作者机构：

关键词： 生物信息学;cry基因;本地核酸序列数据库;本地BLAST

期刊名称： 中国农学通报

ISSN：

年卷期： 2005 年 11 期

页码： 375-378

收录情况： CSCD

摘要： 根据研究的实际需要,运用winSDK设计了一个可视化的BLAST接口程序,利用此程序可以构建本地核酸和蛋白序列数据库与进行本地BLAST。在此基础上建立了苏云金芽孢杆菌(Bt)cry基因的本地核酸序列数据库,并进行了本地BLAST。与先前文献中介绍的本地BLAST实现的方法相比,此方法操作简便、并可根据实际需要随意定制相关数据库;在与NCBI的BLAST进行比较后发现,本地BLAST还具有个性化、准确性强、可信度高等特点。

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[1]Bt cry序列本地数据库的建立及本地BLAST的实现. 宋福平,张广杰,张新会,张杰. 2005

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