叶菜型甘薯叶绿体基因组及其特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李国良

作者： 李国良;张鸿;林赵淼;许泳清;许国春;李华伟;纪荣昌;罗文彬;邱永祥;邱思鑫;汤浩

作者机构：

关键词： 叶菜型甘薯;叶绿体基因组;SSR;系统发育分析

期刊名称： 西南大学学报(自然科学版)

ISSN： 1673-9868

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 43-53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明叶菜型甘薯叶绿体基因组特征及其与番薯属植物的亲缘关系，以叶菜型甘薯‘福菜薯18号’为试验材料，利用BGISEQ-500平台和Oxford Nanopore Technologies单分子测序技术对全基因组进行建库测序，并组装其叶绿体基因组.结果显示：叶菜型甘薯叶绿体基因组全长161 387 bp,具有典型的环状四分体结构，其大单拷贝区（large single copy, LSC）、小单拷贝区（small single copy, SSC）和2个反向重复序列（inverted repeat, IR）的长度分别为87 597, 12 052和30 869 bp.注释共得到132个基因，包含87个蛋白编码基因，8个rRNA基因，37个tRNA基因.在叶菜型甘薯叶绿体基因组中共搜索到54个SSR位点，其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基序个数分别为32, 4, 3, 11, 2和2个.系统进化分析表明，叶菜型甘薯与甘薯四倍体野生种Ipomoea tabascana和二倍体野生种Ipomoea trifida具有较近的亲缘关系.

分类号： S531

  • 相关文献

[1]平托花生叶绿体基因组特征及其系统发育分析. 张小利,刘波,范飞军,朱灵龙,宋度林,李付振. 2024

[2]基于高通量测序组装‘赤霞珠’叶绿体基因组及其特征分析. 谢海坤,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,孙海生,刘崇怀. 2017

[3]芝麻菜叶绿体基因组测序及系统发育关系分析. 沈海斌,卢盼玲,吴珏,刘军林,魏仕伟,张兆辉. 2022

[4]濒危植物秀丽兜兰叶绿体基因组特征与系统发育分析. 范继征,李秀玲,李明智,卜朝阳,何荆洲,曾艳华. 2023

[5]甘蔗野生种割手密叶绿体基因组特征及种内系统进化关系. 余熙恺,余泽怀,张清,张兴坦. 2023

[6]红凤菜叶绿体全基因组特征及其序列比较分析. 赵夏云,瞿飞,杨静,周麟笔,刘炼,文林宏. 2024

[7]黄芪属物种叶绿体基因组蛋白编码基因密码子偏好性分析. 李事超,赵诚贵,姜永成,武自念,田春育,马晖玲. 2025

[8]彩色花椰菜叶绿体全基因组特征分析. 朱惠霞,陶兴林,刘明霞. 2023

[9]大粒香水稻叶绿体基因组特征分析. 吴朝昕,刘雪薇,李祖军,龙武华,宫彦龙,朱速松. 2022

[10]叶菜型甘薯福薯7—6农艺性状及密度研究. 宋吉轩,李云,陈超,彭慧云. 2009

[11]不同氮素水平对叶菜型甘薯光合作用及生长特性的影响. 魏猛,唐忠厚,陈晓光,李洪民,张爱君,史新敏. 2014

[12]不同供氮水平对叶菜型甘薯生理指标及叶绿体结构的影响. 任丽花,余华,罗土炎,黄敏敏,蔡南通,邱永祥. 2011

[13]N对叶菜型甘薯硝酸盐积累及品质的影响. 邱永祥,王伟,蔡南通,吴秋云,罗文彬,柯玉琴. 2005

[14]闽西北特色甘薯产业带建设研究. 邱永祥,邱思鑫,许泳清,刘中华,罗文彬,纪荣昌,李华伟,汤浩. 2013

[15]叶菜型甘薯新品种福薯7-6选育及其配套栽培技术. 蔡南通,黄华康,邱永祥,郑旋,吴秋云,罗文彬,李光星. 2006

[16]直立紧凑型叶菜甘薯新品种福菜薯22的选育. 许泳清,李国良,邱思鑫,刘中华,张鸿,林赵淼,李华伟,纪荣昌,罗文彬,汤浩,阮妙鸿,邱永祥. 2016

[17]叶菜型甘薯栽培技术及施氮安全研究. 蔡南通,邱永祥,吴秋云,罗文彬,李光星. 2006

[18]甘薯茎叶研究发展态势的文献计量分析. 林赵淼,许国春,李国良,张鸿,许泳清,纪荣昌,邱永祥,邱思鑫,汤浩. 2021

[19]甘薯替代控制紫茎泽兰的研究. 杨新笋,胡洪涛,许凌风,李林,陈耕,曹坳程. 2015

[20]叶菜型甘薯在北方水稻育秧大棚的引种研究. 唐傲,孟英,孙兵,王彤彤,董文军,张喜娟. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序