谷子SiPRR37基因对光温、非生物胁迫的响应特点及其有利等位变异鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾小平

作者： 贾小平;李剑峰;张博;全建章;王永芳;赵渊;张小梅;王振山;桑璐曼;董志平

作者机构：

关键词： 谷子;SiPRR37;光温组合;非生物胁迫;表达分析;单倍型

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 47 卷 004 期

页码： 638-649

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从谷子品种延谷11号克隆生物钟基因SiPRR37,通过生物信息学分析、组织特异性表达分析、4种不同光温组合条件的昼夜表达模式分析以及对NaCl、ABA、PEG、低温、Fe 5种非生物胁迫的响应特点分析,揭示SiPRR37参与谷子光温互作调控以及应对非生物胁迫的作用机制;并对160份谷子材料重测序检测SiPRR37基因的突变位点进行单倍型分析,探究该基因对谷子主要农艺性状的影响.结果表明,SiPRR37基因蛋白质编码区(sequence coding for amino acids in protein,CDS)全长2247 bp,编码748个氨基酸,含有REC和CCT 2个结构域,基于PRR37蛋白的系统进化分析发现,谷子与糜子、高粱、玉米亲缘关系最近;启动子预测分析发现,SiPRR37启动子区存在光、温、生长素、赤霉素、脱落酸、茉莉酸甲酯、干旱和盐胁迫等多种应答元件.SiPRR37相对表达量从高到低依次为根、穗颈、穗、顶叶、次顶叶、茎秆;4个光温组合条件SiPRR37均只在光照期出现1个表达峰,无论高温(27℃)还是低温(22℃),短日照相比长日照表达峰均要提前,无论长日照还是短日照,低温(22℃)相比高温(27℃)表达峰均要提前;NaCl、低温(15℃)胁迫能够抑制SiPRR37表达,PEG模拟干旱胁迫和Fe胁迫能够诱导SiPRR37基因表达,SiPRR37参与了ABA信号传导过程.位于SiPRR37 CDS区的10个SNP将160份谷子材料分为19个单倍型,其中3个单倍型(Hap_7、Hap_10、Hap_19)是改善穗部性状的有利单倍型.谷子SiPRR37基因表达具有昼夜节律性,同时受光周期和温度调控,并且参与了谷子对盐胁迫、低温胁迫、干旱胁迫和铁胁迫的应答反应,同时SiPRR37与抽穗期和多个穗部性状相关,在开展谷子高产分子辅助选育中具有一定应用潜力.

分类号：

  • 相关文献

[1]谷子PP2C基因家族的特性. 闵东红,薛飞洋,马亚男,陈明,徐兆师,李连城,刁现民,贾冠清,马有志. 2013

[2]谷子种子线虫检测及分析. 宋振君,李志勇,王永芳,全建章,马继芳,白辉,董志平. 2019

[3]谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析. 宋振君,李志勇,王永芳,任世龙,白辉,董志平. 2019

[4]谷瘟病菌无毒基因AVR1-CO39序列变异及遗传多样性分析. 任世龙,白辉,王永芳,全建章,董志平,李志勇,邢继红. 2018

[5]谷子SiPRR73基因的光温调控模式及非生物胁迫响应特性. 闫留延,李剑峰,张世文,张博,王永芳,张小梅,祖超凡,王振山,桑璐曼,何占祥,贾小平,董志平. 2022

[6]谷子SHMT基因家族全基因组鉴定与表达分析. 郭冰,秦家范,李娜,宋梦瑶,王黎明,李君霞,马小倩. 2025

[7]高温和盐胁迫下硅对辣椒CaMADS-box基因表达的影响. 魏小春,李艳,姚秋菊,原玉香,赵艳艳,王志勇,姜俊,段俊枝,蒋武生,张晓伟. 2016

[8]普通小麦MYB转录因子Tamyb59的克隆及表达分析. 张鹏钰,刘毓侠,曹丽茹,袁珍,王国瑞,王同朝,尹钧,卫丽. 2018

[9]湖北海棠病程相关蛋白MhPR8基因的克隆与表达. 张计育,渠慎春,薛华柏,高志红,郭忠仁,章镇. 2012

[10]橡胶树HbWRKY3的克隆及其响应逆境胁迫的表达分析. 谢黎黎,安泽伟,李雅超,翟琪麟,程汉,方家林,黄华孙. 2013

[11]蒜芥茄SsUBC基因的克隆及表达分析. 董轩名,蔡佳文,郑妍,于丽杰,肖玮,金晓霞,董延龙. 2018

[12]大豆中3个Dof转录因子的生物信息学及表达分析. 翟莹,邱爽,张军,刘春雨,赵艳,李珊珊,张梅娟,邱增城,任巍巍. 2019

[13]马铃薯stuProT1.2基因的克隆与非生物胁迫的表达分析. 王明,谢洁,丁红映,熊兴耀,王万兴,秦玉芝. 2019

[14]番茄NAC转录因子SlNAC80的克隆及表达分析. 刘辉,王涛涛,张俊红,欧阳波,李汉霞. 2015

[15]芹菜bZIP转录因子基因AgbZIP16的逆境响应分析. 沈迪,陈龙正,陶建平,刘洁霞,冯凯,尹莲,徐志胜,熊爱生. 2019

[16]木薯MeHSF8基因克隆及表达分析. 曾坚,莫嘉嘉,吴春来,胡伟. 2020

[17]棉花2个胚胎发育晚期富集蛋白基因的克隆与表达分析. 甄军波,刘迪,宋世佳,刘琳琳,蔡肖,张曦,李海山,迟吉娜. 2019

[18]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[19]木薯MeHSF18基因克隆及表达分析. 曾坚,黄芷颐,章玉香,吴春来,胡伟. 2020

[20]马铃薯AS2基因家族的鉴定与逆境胁迫表达. 梅超,刘玉卫,孙蕾,王慧杰,董雪,李欣,冯瑞云. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序