水禽细小病毒选择压力与基因重组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪宏才

作者： 汪宏才;商雨;郭云清;曾哲;张蓉蓉;温国元;罗青平

作者机构：

关键词： 水禽细小病毒;新型鹅细小病毒;分离鉴定;选择压力;基因重组

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2023 年 62 卷 011 期

页码： 191-197

收录情况： 北大核心

摘要： 通过对临床水禽细小病毒进行PCR检测、基因组测序和进化分析,确定分离毒株的基因型.进一步通过Paml、RDP软件对分离株的基因组进行选择压力和基因重组分析,确定分离株的演化趋势.结果表明,分离的3株水禽细小病毒均属于新型鹅细小病毒,分别命名为YiCH株、AnQ株和XiY株,基因组长度分别为5 056、5 056、5 068 bp.3个分离株与新型鹅细小病毒M15株亲源关系最近,其中XiY株两端ITR区域191~196位、4 878~4 883位均有6个碱基插入.对分离株进行选择压力分析,分离株VP蛋白检测出3个正选择位点,分别为116Q、261A、485S.重组分析显示,分离株YiCH株和AnQ株都存在重组现象,以XiY株为主要亲本株、GPV 06-0329株为次要亲本株重组而成.

分类号： S855.3

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