基于HRM技术的大白菜InDel标记高效检测技术构建及其应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张志刚

作者： 张志刚;司立英;赵智中;王荣花;王立华;李巧云;刘栓桃

作者机构：

关键词： 大白菜;插入/缺失标记;高分辨率熔解曲线分析;高效检测技术

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2018 年 10 期

页码： 128-133

摘要： 高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)分析技术是基于核酸小片段之间的GC含量差异而导致双链核酸解链温度差异的一门检测技术,更多地被用于特定类型的单碱基突变筛查,很少见用于插入/缺失突变的检测。本研究从前期鉴定的可以有效区分大白菜自交系He102与06-247的593对多态性InDel引物中筛选到271对特异性好、呈共显性分布的InDel引物,采用软件TMUtility_1.5预测了差异目标片段的熔解温度(Tm)值,发现63对标记的Tm差值满足HRM分型的灵敏度(差值绝对值≥0.2℃)要求,进一步采用梯度PCR技术对上述63对引物进行PCR扩增和HRM分型,从中鉴定出20对适宜进行HRM分型的InDel标记。构建了适宜LightScanner-96高分辨率熔解曲线分析仪分析的高效检测体系,并在大白菜种质基因型精准鉴定、杂交种纯度高效鉴定方面得到成功应用。本研究开发的适宜HRM分型的InDel标记还可以作为一种标记储备用于构建遗传连锁图谱和DNA指纹图谱、鉴定杂交种纯度和真实性、关联分析、分子标记辅助育种等。基于此构建的高通量检测方法也为其它动植物材料InDel标记的高通量检测和应用提供借鉴。

分类号： S634.1

  • 相关文献

[1]基于InDels标记的大白菜育种材料的亲缘关系鉴定. 刘栓桃,张志刚,司立英,王荣花,李巧云,王立华,赵智中,梁水美,张全芳,步迅. 2018

[2]利用插入/缺失标记分析我国瓠瓜资源遗传多样性. 鲁忠富,王莎,吴晓花,胡耀文,汪宝根,吴新义,徐沛,李国景. 2014

[3]两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用. 杨润婷,吴波,李翀,曾培,曾继吾,钟云,姜波,周碧容,钟广炎. 2013

[4]高分辨率熔解曲线分析法检测牦牛脂蛋白脂酶外显子7的多态性及与生长性状相关性分析. 扎西卓玛,郭宪,阎萍,吴晓云,王宏博,刘建,杨安圈,张德虎,王照忠. 2013

[5]应用高分辨率熔解曲线(HRM)开发大菱鲆(Scophthalmus maximus)SNP标记的研究. 刘庆明,李猛,马爱军,王新安,黄智慧,郭建丽. 2012

[6]基于HRM分析技术的家蚕眠性主基因M的精细定位. 刘晓晓,张洁葵,张业顺,杨思思,夏定国. 2013

[7]大棚番茄、丝瓜、大白菜、芹菜高效栽培模式. 顾正荣,刘水东,顾国华,姜永平. 2010

[8]大白菜新品种-辽白5号. 王德生. 2000

[9]强冬性大白菜黔白9号的选育及反季节栽培技术. 彭莉,马超,潘业勤,杨跃虎,赵大芹. 2014

[10]早熟大白菜新品种天白65的选育. 闻凤英,张斌,刘晓晖,罗智敏,王超楠,黄志银,李梅. 2017

[11]高产优质的三个大白菜新品种. 郭景芬. 2002

[12]春大白菜—水稻—秋冬南瓜一年三季高效栽培技术. 周麟笔,李琼芬,王惠科,赵夏云,李桂莲,文林宏. 2016

[13]露地越冬大白菜品种筛选试验. 罗孝明,祁斌,赵大芹. 2017

[14]早熟青麻叶大白菜新品种珍绿60的选育. 闻凤英,张斌,刘晓晖,王超楠,黄志银,李梅,张红. 2017

[15]不同处理方法对耐抽薹大白菜亲本材料开花期的调控效应. 赵大芹,彭剑涛,林宏,祁斌,彭莉,李桂莲. 2014

[16]耐热夏播大白菜新品种津夏3号的选育. 闻凤英,张斌,刘晓晖,宋连久,赵冰,罗智敏. 2005

[17]白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记研究. 郭晶心,周乃元,马荣才,曹鸣庆. 2002

[18]大白菜耐抽薹育种研究进展. 赵建锋,秦进华,孙玉东,罗德旭,朱明超,丁鹏. 2009

[19]‘淮阴小狮头’大白菜母株制种技术. 赵建锋,王伟中,孙玉东,罗德旭,张朝阳. 2011

[20]连云港地区高产优质大白菜引种观察试验. 薛萍,宁宇,杨海峰,陈振泰,潘美红,罗志丹,杨和川. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序