树莓SSR反应体系的优化及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张玉平

作者： 张玉平;潘青华;金万梅;孥少守;许奕华;姜明;韩振海

作者机构：

关键词： 树莓;SSR;体系优化;应用

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2011 年 16 卷 06 期

页码： 64-69

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究主要对树莓SSR-PCR体系进行优化,以‘来味里(Reveille)’红树莓为试材,利用L9(34)正交试验设计和两因素完全随机试验,研究各主要参数的适宜浓度,建立适合树莓SSR反应的最佳体系,并通过16个不同的树莓栽培品种对优化后的体系进行验证。结果表明:各影响因素中,引物浓度的变化对扩增结果的影响最大,优化后的最佳反应体系(25μL)中,Taq DNA聚合酶和DNA最适用量分别为1.0U和30ng;Mg2+、dNTP和引物最适浓度分别为1.5、0.2mmol/L和0.4μmol/L。利用优化后的反应体系和10对SSR引物对16个树莓品种进行PCR扩增,不同品种间扩增结果稳定,多态性位点丰富,共有54个等位位点,表明该体系稳定可靠,适合树莓的SSR分析。

分类号： S663.2

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